論文の概要: A publicly available vessel segmentation algorithm for SLO images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2311.17525v1
- Date: Wed, 29 Nov 2023 10:53:08 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-11-30 21:41:45.441631
- Title: A publicly available vessel segmentation algorithm for SLO images
- Title(参考訳): SLO画像のための公開容器分割アルゴリズム
- Authors: Adam Threlfall, Samuel Gibbon, James Cameron, Tom MacGillivray
- Abstract要約: Infra-red scanning laser ophthalmoscope (IRSLO) 画像は、後極と網膜血管の微細な細部を表示する際の眼底のカラー写真と類似している。
IRSLO画像に特化した血管分割アルゴリズムを開発した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Background and Objective: Infra-red scanning laser ophthalmoscope (IRSLO)
images are akin to colour fundus photographs in displaying the posterior pole
and retinal vasculature fine detail. While there are many trained networks
readily available for retinal vessel segmentation in colour fundus photographs,
none cater to IRSLO images. Accordingly, we aimed to develop (and release as
open source) a vessel segmentation algorithm tailored specifically to IRSLO
images. Materials and Methods: We used 23 expertly annotated IRSLO images from
the RAVIR dataset, combined with 7 additional images annotated in-house. We
trained a U-Net (convolutional neural network) to label pixels as 'vessel' or
'background'. Results: On an unseen test set (4 images), our model achieved an
AUC of 0.981, and an AUPRC of 0.815. Upon thresholding, it achieved a
sensitivity of 0.844, a specificity of 0.983, and an F1 score of 0.857.
Conclusion: We have made our automatic segmentation algorithm publicly
available and easy to use. Researchers can use the generated vessel maps to
compute metrics such as fractal dimension and vessel density.
- Abstract(参考訳): 背景と目的:赤外線走査型レーザー眼科鏡(IRSLO)画像は、後極と網膜血管の微細な細部を表示する際の眼底写真に類似している。
カラー眼底写真では網膜血管のセグメンテーションに容易に利用できる訓練済みのネットワークが多数存在するが、IRSLO画像には対応していない。
そこで我々は,irslo画像専用に設計した容器分割アルゴリズムの開発(およびオープンソースとしてリリース)を目標とした。
Materials and Methods: RAVIRデータセットから得られた23の専門的な注釈付きIRSLO画像と7つの追加的な注釈付き画像を使用した。
u-net (convolutional neural network) をトレーニングして,ピクセルを 'vessel' または 'background' とラベル付けした。
結果: 未確認テストセット(4画像)では, AUCが0.981, AUPRCが0.815であった。
しきい値は0.844、特異度0.983、f1スコア0.857であった。
結論: 自動セグメンテーションアルゴリズムを一般公開し,利用しやすくした。
研究者は生成した血管マップを使用してフラクタル次元や血管密度などのメトリクスを計算することができる。
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