論文の概要: A Generative Self-Supervised Framework using Functional Connectivity in
fMRI Data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2312.01994v1
- Date: Mon, 4 Dec 2023 16:14:43 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-12-05 14:38:52.058230
- Title: A Generative Self-Supervised Framework using Functional Connectivity in
fMRI Data
- Title(参考訳): fMRIデータにおける関数接続性を用いた自己監督型フレームワーク
- Authors: Jungwon Choi, Seongho Keum, EungGu Yun, Byung-Hoon Kim, Juho Lee
- Abstract要約: 機能的磁気共鳴イメージング(fMRI)データから抽出した機能的接続性(FC)ネットワークを訓練したディープニューラルネットワークが人気を博している。
グラフニューラルネットワーク(GNN)のFCへの適用に関する最近の研究は、FCの時間変化特性を活用することにより、モデル予測の精度と解釈可能性を大幅に向上させることができることを示唆している。
高品質なfMRIデータとそれに対応するラベルを取得するための高コストは、実環境において彼らのアプリケーションにハードルをもたらす。
本研究では,動的FC内の時間情報を効果的に活用するためのSSL生成手法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 15.211387244155725
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Deep neural networks trained on Functional Connectivity (FC) networks
extracted from functional Magnetic Resonance Imaging (fMRI) data have gained
popularity due to the increasing availability of data and advances in model
architectures, including Graph Neural Network (GNN). Recent research on the
application of GNN to FC suggests that exploiting the time-varying properties
of the FC could significantly improve the accuracy and interpretability of the
model prediction. However, the high cost of acquiring high-quality fMRI data
and corresponding phenotypic labels poses a hurdle to their application in
real-world settings, such that a model na\"ively trained in a supervised
fashion can suffer from insufficient performance or a lack of generalization on
a small number of data. In addition, most Self-Supervised Learning (SSL)
approaches for GNNs to date adopt a contrastive strategy, which tends to lose
appropriate semantic information when the graph structure is perturbed or does
not leverage both spatial and temporal information simultaneously. In light of
these challenges, we propose a generative SSL approach that is tailored to
effectively harness spatio-temporal information within dynamic FC. Our
empirical results, experimented with large-scale (>50,000) fMRI datasets,
demonstrate that our approach learns valuable representations and enables the
construction of accurate and robust models when fine-tuned for downstream
tasks.
- Abstract(参考訳): 機能的磁気共鳴イメージング(fMRI)データから抽出された機能的接続性(FC)ネットワークを訓練したディープニューラルネットワークは、データの利用可能性の向上とグラフニューラルネットワーク(GNN)を含むモデルアーキテクチャの進歩により人気を博している。
gnnのfcへの適用に関する最近の研究は、fcの時間変動特性を活用すれば、モデル予測の精度と解釈性が大幅に向上することを示唆している。
しかし、高品質なfMRIデータとそれに対応する表現型ラベルを取得するための高コストは、教師付き方式で"訓練されたモデルna\"が、少数のデータに対する性能の不足や一般化の欠如に悩まされるような、現実的な環境での彼らの応用にハードルをもたらす。
さらに、GNNの従来の自己監視学習(SSL)アプローチでは、グラフ構造が乱れていたり、空間的情報と時間的情報の両方を同時に利用しなかったりすると、適切な意味情報を失う傾向にある。
これらの課題を踏まえて,動的FC内の時空間情報を効果的に活用するための生成型SSL手法を提案する。
大規模な(>50,000)fMRIデータセットを用いて実験した実験結果から,提案手法が重要な表現を学習し,下流タスクの微調整を行う際に,正確かつ堅牢なモデルの構築を可能にすることを示す。
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