論文の概要: AIRI: Predicting Retention Indices and their Uncertainties using
Artificial Intelligence
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2401.01506v2
- Date: Wed, 17 Jan 2024 16:53:09 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-01-18 19:39:47.938509
- Title: AIRI: Predicting Retention Indices and their Uncertainties using
Artificial Intelligence
- Title(参考訳): AIRI:人工知能を用いた保存指標とその不確かさの予測
- Authors: Lewis Y. Geer, Stephen E. Stein, William Gary Mallard, Douglas J.
Slotta
- Abstract要約: 我々は、標準セミポーラカラムの構造からRI値を予測するためのディープニューラルネットワークの利用について検討する。
ネットワークの精度のため、NIST EI-MSスペクトルライブラリのRI値を予測するために使用された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/
- Abstract: The Kov\'ats Retention index (RI) is a quantity measured using gas
chromatography and commonly used in the identification of chemical structures.
Creating libraries of observed RI values is a laborious task, so we explore the
use of a deep neural network for predicting RI values from structure for
standard semipolar columns. This network generated predictions with a mean
absolute error of 15.1 and, in a quantification of the tail of the error
distribution, a 95th percentile absolute error of 46.5. Because of the
Artificial Intelligence Retention Indices (AIRI) network's accuracy, it was
used to predict RI values for the NIST EI-MS spectral libraries. These RI
values are used to improve chemical identification methods and the quality of
the library. Estimating uncertainty is an important practical need when using
prediction models. To quantify the uncertainty of our network for each
individual prediction, we used the outputs of an ensemble of 8 networks to
calculate a predicted standard deviation for each RI value prediction. This
predicted standard deviation was corrected to follow the error between observed
and predicted RI values. The Z scores using these predicted standard deviations
had a standard deviation of 1.52 and a 95th percentile absolute Z score
corresponding to a mean RI value of 42.6.
- Abstract(参考訳): Kov\'ats Retention Index (RI) はガスクロマトグラフィーを用いて測定され、化学構造の同定によく用いられる。
観測されたRI値のライブラリを作成することは面倒な作業であるため、標準的なセミポーラ列の構造からRI値を予測するためのディープニューラルネットワークの利用について検討する。
このネットワークは、平均絶対誤差が15.1で予測し、誤差分布のテールの定量化において、95%の絶対誤差が46.5である。
人工知能保持指標(AIRI)ネットワークの精度のため、NIST EI-MSスペクトルライブラリのRI値を予測するために使用された。
これらのRI値は、化学同定法とライブラリの品質を向上させるために使用される。
予測モデルを使用する場合、不確実性の推定は重要な実用的必要性である。
個々の予測毎にネットワークの不確かさを定量化するため,各RI値の予測値に対して,予測標準偏差を計算するために8ネットワークのアンサンブルの出力を用いた。
この標準偏差は観測値と予測値の誤差に従うように補正された。
これらの標準偏差を用いたzスコアは、平均ri値42.6に対応する標準偏差1.52と95%の絶対zスコアであった。
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