論文の概要: Machine Learning to Promote Translational Research: Predicting Patent
and Clinical Trial Inclusion in Dementia Research
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2401.05145v1
- Date: Wed, 10 Jan 2024 13:25:49 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-01-11 14:45:22.689409
- Title: Machine Learning to Promote Translational Research: Predicting Patent
and Clinical Trial Inclusion in Dementia Research
- Title(参考訳): 翻訳研究を促進する機械学習--認知症研究における特許と治験の予測
- Authors: Matilda Beinat, Julian Beinat, Mohammed Shoaib, Jorge Gomez Magenti
- Abstract要約: 認知症は、2040年までに英国で6100万人に影響を及ぼし、年間25億ポンドの費用がかかると予想されている。
1990~2023年の間に、イギリスの認知症研究出版物43,091件からDmensionsデータベースを用いてデータを抽出した。
特許の予測では、受信者動作特性曲線(AUROC)の精度は0.84と77.17%であり、臨床試験の精度は0.81と75.11%である。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Projected to impact 1.6 million people in the UK by 2040 and costing
{\pounds}25 billion annually, dementia presents a growing challenge to society.
This study, a pioneering effort to predict the translational potential of
dementia research using machine learning, hopes to address the slow translation
of fundamental discoveries into practical applications despite dementia's
significant societal and economic impact. We used the Dimensions database to
extract data from 43,091 UK dementia research publications between the years
1990-2023, specifically metadata (authors, publication year etc.), concepts
mentioned in the paper, and the paper abstract. To prepare the data for machine
learning we applied methods such as one hot encoding and/or word embeddings. We
trained a CatBoost Classifier to predict if a publication will be cited in a
future patent or clinical trial. We trained several model variations. The model
combining metadata, concept, and abstract embeddings yielded the highest
performance: for patent predictions, an Area Under the Receiver Operating
Characteristic Curve (AUROC) of 0.84 and 77.17% accuracy; for clinical trial
predictions, an AUROC of 0.81 and 75.11% accuracy. The results demonstrate that
integrating machine learning within current research methodologies can uncover
overlooked publications, expediting the identification of promising research
and potentially transforming dementia research by predicting real-world impact
and guiding translational strategies.
- Abstract(参考訳): 認知症は、2040年までに英国で6100万人に影響を及ぼし、年間2500億ポンドの費用がかかると予想されている。
機械学習を用いた認知症研究の翻訳可能性を予測する先駆的な試みである本研究は、認知症が社会的・経済的に重大な影響を及ぼすにもかかわらず、基礎的な発見を実践的な応用にゆっくりと翻訳することを目指している。
1990-2023年のイギリス認知症研究出版物43,091件、特にメタデータ(著者、出版年など)、論文のコンセプト、および論文要約からデータを抽出するためにDmensionsデータベースを使用した。
機械学習のためのデータを作成するために、1つのホットエンコーディングや単語埋め込みなどの手法を適用した。
今後の特許や臨床試験で出版物が引用されるかどうかを予測するために,catboost分類器を訓練した。
私たちはいくつかのモデルのバリエーションを訓練した。
メタデータ、概念、抽象埋め込みを組み合わせたモデルは、最も高い性能を得た:特許予測では、受信者の動作特性曲線(auroc)の下の領域は 0.84 と 77.17% の精度であり、臨床試験の予測では 0.81 と 75.11% の精度である。
その結果、現在の研究手法に機械学習を統合することで、見過ごされた出版物を発見でき、将来的な研究の特定を迅速化し、現実のインパクトを予測し、翻訳戦略を導くことで認知症研究を変革する可能性が示された。
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