論文の概要: Skeleton-Guided Instance Separation for Fine-Grained Segmentation in Microscopy

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2401.09895v2
• Date: Fri, 19 Jan 2024 05:27:15 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2024-01-22 12:16:31.496596
• Title: Skeleton-Guided Instance Separation for Fine-Grained Segmentation in Microscopy
• Title（参考訳）: 顕微鏡における細粒化セグメンテーションのための骨格誘導型インスタンス分離
• Authors: Jun Wang, Chengfeng Zhou, Zhaoyan Ming, Lina Wei, Xudong Jiang, and Dahong Qian
• Abstract要約: 顕微鏡(MS)画像解析における基本的な課題の1つは、インスタンスセグメンテーション(IS)である。 我々は,この課題に対処し,MS画像におけるISの精度を高めるために,A2B-ISという新しいワンステージフレームワークを提案する。 提案手法は2つの大規模MSデータセットに対して徹底的に検証されている。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 23.848474219551818
• License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
• Abstract: One of the fundamental challenges in microscopy (MS) image analysis is instance segmentation (IS), particularly when segmenting cluster regions where multiple objects of varying sizes and shapes may be connected or even overlapped in arbitrary orientations. Existing IS methods usually fail in handling such scenarios, as they rely on coarse instance representations such as keypoints and horizontal bounding boxes (h-bboxes). In this paper, we propose a novel one-stage framework named A2B-IS to address this challenge and enhance the accuracy of IS in MS images. Our approach represents each instance with a pixel-level mask map and a rotated bounding box (r-bbox). Unlike two-stage methods that use box proposals for segmentations, our method decouples mask and box predictions, enabling simultaneous processing to streamline the model pipeline. Additionally, we introduce a Gaussian skeleton map to aid the IS task in two key ways: (1) It guides anchor placement, reducing computational costs while improving the model's capacity to learn RoI-aware features by filtering out noise from background regions. (2) It ensures accurate isolation of densely packed instances by rectifying erroneous box predictions near instance boundaries. To further enhance the performance, we integrate two modules into the framework: (1) An Atrous Attention Block (A2B) designed to extract high-resolution feature maps with fine-grained multiscale information, and (2) A Semi-Supervised Learning (SSL) strategy that leverages both labeled and unlabeled images for model training. Our method has been thoroughly validated on two large-scale MS datasets, demonstrating its superiority over most state-of-the-art approaches.
• Abstract（参考訳）: 顕微鏡(MS)画像解析における基本的な課題の1つはインスタンスセグメンテーション(IS)であり、特にサイズや形状の異なる複数のオブジェクトが任意の向きに連結したり重なり合ったりする場合である。 既存のisメソッドは通常、キーポイントや水平境界ボックス(h-bboxes)といった粗いインスタンス表現に依存するため、そのようなシナリオを扱うのに失敗する。 本稿では,この課題に対処し,MS画像におけるISの精度を高めるために,A2B-ISという新しいワンステージフレームワークを提案する。 このアプローチは各インスタンスをピクセルレベルのマスクマップと回転したバウンディングボックス(r-bbox)で表現する。 セグメンテーションにボックスプロポーザルを使用する2段階の手法とは異なり、我々の手法はマスクとボックス予測を分離し、同時処理でモデルパイプラインを合理化することができる。 さらに,(1)アンカー配置をガイドし,計算コストを低減しつつ,背景領域からノイズを除去してRoI対応の特徴を学習する能力を向上させるという,ISタスクを支援するガウススケルトンマップを導入する。 2) インスタンス境界付近の誤ったボックス予測を正すことで,密集したインスタンスの正確な分離を実現する。 性能をさらに向上するため,(1)高精細なマルチスケール情報を持つ高精細な特徴マップを抽出するために設計されたA2B(Atrous Attention Block)と,(2)ラベル付き画像と未ラベル画像の両方をモデルトレーニングに活用するSemi-Supervised Learning(SSL)戦略の2つのモジュールをフレームワークに統合した。 本手法は,2つの大規模msデータセット上で徹底的に検証され,最先端手法よりも優れていることを示す。

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