論文の概要: SEDNet: Shallow Encoder-Decoder Network for Brain Tumor Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2401.13403v3
- Date: Tue, 17 Sep 2024 04:23:16 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-09-18 22:41:00.723867
- Title: SEDNet: Shallow Encoder-Decoder Network for Brain Tumor Segmentation
- Title(参考訳): SEDNet:脳腫瘍分離のための浅層エンコーダデコーダネットワーク
- Authors: Chollette C. Olisah, Sofie V. Cauter,
- Abstract要約: 本稿では,SEDNetと呼ばれる新しい浅層エンコーダとデコーダネットワークを含む腫瘍セグメンテーションフレームワークを提案する。
SEDNetのハイライトは、階層的畳み込みダウンサンプリングにおける十分さと、コスト効率が高く効果的な脳腫瘍セマンティックセグメンテーションのための選択的スキップメカニズムである。
SEDNet(X)は、約130万のパラメータと、最先端のSEDNet(X)と比較すると、リアルタイム臨床診断において計算的に効率的であることが示されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Despite the advancement in computational modeling towards brain tumor segmentation, of which several models have been developed, it is evident from the computational complexity of existing models that performance and efficiency under clinical application scenarios are still limited. Therefore, this paper proposes a tumor segmentation framework. It includes a novel shallow encoder and decoder network named SEDNet for brain tumor segmentation. The highlights of SEDNet include sufficiency in hierarchical convolutional downsampling and selective skip mechanism for cost-efficient and effective brain tumor semantic segmentation, among other features. The preprocessor and optimization function approaches are devised to minimize the uncertainty in feature learning impacted by nontumor slices or empty masks with corresponding brain slices and address class imbalances as well as boundary irregularities of tumors, respectively. Through experiments, SEDNet achieved impressive dice and Hausdorff scores of 0.9308 %, 0.9451 %, and 0.9026 %, and 0.7040 mm, 1.2866 mm, and 0.7762 mm for the non-enhancing tumor core (NTC), peritumoral edema (ED), and enhancing tumor (ET), respectively. This is one of the few works to report segmentation performance on NTC. Furthermore, through transfer learning with initialized SEDNet pre-trained weights, termed SEDNetX, a performance increase is observed. The dice and Hausdorff scores recorded are 0.9336%, 0.9478%, 0.9061%, 0.6983 mm, 1.2691 mm, and 0.7711 mm for NTC, ED, and ET, respectively. With about 1.3 million parameters and impressive performance in comparison to the state-of-the-art, SEDNet(X) is shown to be computationally efficient for real-time clinical diagnosis. The code is available on Github .
- Abstract(参考訳): いくつかのモデルが開発されている脳腫瘍セグメンテーションに対する計算モデリングの進歩にもかかわらず、既存のモデルの計算複雑性から、臨床応用シナリオにおける性能と効率が制限されていることは明らかである。
そこで本研究では腫瘍分節の枠組みを提案する。
それは、脳腫瘍セグメンテーションのための新しい浅いエンコーダとSEDNetと呼ばれるデコーダネットワークを含んでいる。
SEDNetのハイライトは、階層的畳み込みダウンサンプリングにおける十分性や、コスト効率が高く効果的な脳腫瘍セマンティックセグメンテーションのための選択的スキップ機構などである。
プリプロセッサと最適化関数のアプローチは、腫瘍の境界不規則性に加えて、対応する脳スライスとアドレスクラス不均衡を持つ非腫瘍スライスまたは空マスクによって影響を受ける特徴学習の不確実性を最小限に抑えるために考案された。
実験により,SEDNetは,非エンハンシング腫瘍コア (NTC), 縦隔浮腫 (ED), 造影腫瘍 (ET) に対して0.9308 %, 0.9451 %, 0.9026 %, 0.7040 mm, 1.2866 mm, 0.7762 mm の有意な評価を得た。
これはNTCでセグメンテーション性能を報告した数少ない作品の1つである。
さらに、SEDNetXと呼ばれる初期化SEDNet事前学習重みによる転送学習により、性能向上が観測された。
ダイスとハウスドルフのスコアはそれぞれ0.9336%、0.9478%、0.9061%、0.6983mm、1.2691mm、0.7711mmである。
SEDNet(X)は、約130万のパラメータと、最先端のSEDNet(X)と比較すると、リアルタイム臨床診断において計算的に効率的であることが示されている。
コードはGithubで入手できる。
関連論文リスト
- MBDRes-U-Net: Multi-Scale Lightweight Brain Tumor Segmentation Network [0.0]
本研究では,マルチブランチ残差ブロックを統合した3次元U-Netフレームワークを用いたMBDRes-U-Netモデルを提案する。
モデルの計算負担は分岐戦略によって低減され、マルチモーダル画像のリッチな局所的特徴を効果的に活用する。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-11-04T09:03:43Z) - Prototype Learning Guided Hybrid Network for Breast Tumor Segmentation in DCE-MRI [58.809276442508256]
本稿では,畳み込みニューラルネットワーク(CNN)とトランスフォーマー層を組み合わせたハイブリッドネットワークを提案する。
プライベートおよびパブリックなDCE-MRIデータセットの実験結果から,提案したハイブリッドネットワークは最先端の手法よりも優れた性能を示した。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-08-11T15:46:00Z) - TotalSegmentator MRI: Sequence-Independent Segmentation of 59 Anatomical Structures in MR images [62.53931644063323]
本研究では,TotalSegmentatorをMR画像に拡張した。
このデータセットに基づいてnnU-Netセグメンテーションアルゴリズムを訓練し、類似度係数(Dice)を計算し、モデルの性能を評価した。
このモデルは、他の2つの公開セグメンテーションモデル(Dice score 0.824 vs 0.762; p0.001 and 0.762 versus 0.542; p)を大きく上回った。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-05-29T20:15:54Z) - LATUP-Net: A Lightweight 3D Attention U-Net with Parallel Convolutions for Brain Tumor Segmentation [7.1789008189318455]
LATUP-Netは、並列畳み込みを備えた軽量な3DアテンションU-Netである。
高いセグメンテーション性能を維持しつつ、計算要求を大幅に削減するように設計されている。
BraTS 2020データセットの平均Diceスコアは88.41%、83.82%、73.67%であり、BraTS 2021データセットでは、それぞれ90.29%、89.54%、83.92%である。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-04-09T00:05:45Z) - propnet: Propagating 2D Annotation to 3D Segmentation for Gastric Tumors
on CT Scans [16.135854257728337]
本研究は,3次元腫瘍セグメンテーションの課題に対処するために,人間の誘導した知識とユニークなモジュールを利用したモデルを提案する。
98件の患者スキャンと30件のバリデーションを行い,手作業によるアノテーション(約0.803)との相当な一致を実現し,効率を向上する。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-05-29T03:24:02Z) - Multi-class Brain Tumor Segmentation using Graph Attention Network [3.3635982995145994]
この研究は、MRIとグラフニューラルネットワーク(GNN)の進歩を生かして、効率的な脳腫瘍要約モデルを導入する。
このモデルは、ボリュームMRIを領域隣接グラフ(RAG)として表現し、グラフ注意ネットワーク(GAT)を通して腫瘍の種類を特定することを学習する。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-02-11T04:30:40Z) - Hybrid Window Attention Based Transformer Architecture for Brain Tumor
Segmentation [28.650980942429726]
細かな特徴を抽出するための2つのウィンドウ化戦略に従うボリューム視覚変換器を提案する。
FeTS Challenge 2022データセット上で,ネットワークアーキテクチャをトレーニングし,評価した。
オンライン検証データセットのパフォーマンスは以下の通りである。 Dice similarity Score of 81.71%, 91.38%, 85.40%。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-09-16T03:55:48Z) - HNF-Netv2 for Brain Tumor Segmentation using multi-modal MR Imaging [86.52489226518955]
我々は,HNF-NetをHNF-Netv2に拡張する。
我々の方法は、RSNA 2021脳腫瘍AIチャレンジ賞(セグメンテーション・タスク)を受賞しました。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-02-10T06:34:32Z) - EMT-NET: Efficient multitask network for computer-aided diagnosis of
breast cancer [58.720142291102135]
乳腺腫瘍の分類と分別を同時に行うための,効率的で軽量な学習アーキテクチャを提案する。
腫瘍分類ネットワークにセグメンテーションタスクを組み込むことにより,腫瘍領域に着目したバックボーンネットワークで表現を学習する。
腫瘍分類の精度、感度、特異性はそれぞれ88.6%、94.1%、85.3%である。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-01-13T05:24:40Z) - H2NF-Net for Brain Tumor Segmentation using Multimodal MR Imaging: 2nd
Place Solution to BraTS Challenge 2020 Segmentation Task [96.49879910148854]
当社のH2NF-Netは、単一およびカスケードのHNF-Netを使用して、異なる脳腫瘍サブリージョンを分割します。
我々は、マルチモーダル脳腫瘍チャレンジ(BraTS)2020データセットでモデルをトレーニングし、評価した。
提案手法は,80名近い参加者のうち,brats 2020チャレンジセグメンテーションタスクで2位となった。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-12-30T20:44:55Z) - Brain tumor segmentation with self-ensembled, deeply-supervised 3D U-net
neural networks: a BraTS 2020 challenge solution [56.17099252139182]
U-netのようなニューラルネットワークを用いた脳腫瘍セグメント化作業の自動化と標準化を行う。
2つの独立したモデルのアンサンブルが訓練され、それぞれが脳腫瘍のセグメンテーションマップを作成した。
我々の解は、最終試験データセットにおいて、Diceの0.79、0.89、0.84、およびHausdorffの95%の20.4、6.7、19.5mmを達成した。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-10-30T14:36:10Z)
関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。
指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト(すべての情報・翻訳含む)の品質を保証せず、本サイト(すべての情報・翻訳含む)を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。