論文の概要: MRAnnotator: multi-Anatomy and many-Sequence MRI segmentation of 44 structures
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2402.01031v2
- Date: Tue, 11 Feb 2025 16:23:09 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-02-12 18:22:47.506987
- Title: MRAnnotator: multi-Anatomy and many-Sequence MRI segmentation of 44 structures
- Title(参考訳): MR Annotator:44構造のマルチ解剖学的および多系列MRIセグメント化
- Authors: Alexander Zhou, Zelong Liu, Andrew Tieu, Nikhil Patel, Sean Sun, Anthony Yang, Peter Choi, Hao-Chih Lee, Mickael Tordjman, Louisa Deyer, Yunhao Mei, Valentin Fauveau, George Soultanidis, Bachir Taouli, Mingqian Huang, Amish Doshi, Zahi A. Fayad, Timothy Deyer, Xueyan Mei,
- Abstract要約: 対象は,マウント・シナイ・ヘルス・システム (Mount Sinai Health System) の843例のMRI1,518例の内的データセットと,ベンチマーク対象263例のMRI397例の外部的データセットである。
内部データセットはnnU-NetモデルMRAnnotatorをトレーニングし、外部データセットに強い一般化性を示した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 27.956507678338824
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: In this retrospective study, we annotated 44 structures on two datasets: an internal dataset of 1,518 MRI sequences from 843 patients at the Mount Sinai Health System, and an external dataset of 397 MRI sequences from 263 patients for benchmarking. The internal dataset trained the nnU-Net model MRAnnotator, which demonstrated strong generalizability on the external dataset. MRAnnotator outperformed existing models such as TotalSegmentator MRI and MRSegmentator on both datasets, achieving an overall average Dice score of 0.878 on the internal dataset and 0.875 on the external set. Model weights are available on GitHub, and the external test set can be shared upon request.
- Abstract(参考訳): 本研究の振り返りとして,マウント・シナイ・ヘルス・システム (Mount Sinai Health System) の843例のMRI1,518例の内的データセットと,ベンチマークのために263例のMRI397例のMRI397例の外部的データセットの2つのデータセットについて,44例のアノテートを行った。
内部データセットはnnU-NetモデルMRAnnotatorをトレーニングし、外部データセットに強い一般化性を示した。
MRAnnotatorは、両方のデータセットでTotalSegmentator MRIやMSSegmentatorといった既存のモデルより優れており、内部データセットで全体の平均Diceスコアが0.878、外部データセットで0.875である。
モデルウェイトはGitHubで入手でき、外部テストセットはリクエストに応じて共有できる。
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