論文の概要: A flexible Bayesian g-formula for causal survival analyses with time-dependent confounding
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2402.02306v2
- Date: Sat, 29 Jun 2024 01:30:58 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-07-02 15:18:25.451322
- Title: A flexible Bayesian g-formula for causal survival analyses with time-dependent confounding
- Title(参考訳): 時間依存コンバウンディングを用いた因果生存解析のための柔軟なベイズ型g-formula
- Authors: Xinyuan Chen, Liangyuan Hu, Fan Li,
- Abstract要約: 因果解析の一般的な目的は、仮説的介入シナリオの下で因果生存曲線を推定することである。
従来のパラメトリック g-formula アプローチを強化するため,より適応性の高いベイズ型 g-formula 推定器を開発した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 11.481436666029644
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: In longitudinal observational studies with a time-to-event outcome, a common objective in causal analysis is to estimate the causal survival curve under hypothetical intervention scenarios within the study cohort. The g-formula is a particularly useful tool for this analysis. To enhance the traditional parametric g-formula approach, we developed a more adaptable Bayesian g-formula estimator, which incorporates the Bayesian additive regression trees (BART) in the modeling of the time-evolving generative components, aiming to mitigate bias due to model misspecification. Specifically, we introduce a more general class of g-formulas for discrete survival data that can incorporate the longitudinal balancing scores, which serve as an effective method for dimension reduction and are vital when dealing with an expanding array of time-varying confounders. The minimum sufficient formulation of these longitudinal balancing scores is linked to the nature of treatment regimes, whether static or dynamic. For each type of treatment regime, we provide posterior sampling algorithms grounded in the BART framework. We have conducted simulation studies to illustrate the empirical performance of the proposed method and further demonstrate its practical utility using data from the Yale New Haven Health System's (YNHHS) electronic health records.
- Abstract(参考訳): 時系列観察研究における因果解析の一般的な目的は、仮説的介入のシナリオの下で因果的生存曲線を推定することである。
g-formulaはこの解析に特に有用なツールである。
従来のパラメトリックなg-formulaアプローチを強化するために,ベイジアン加法回帰木(BART)をモデル不特定性によるバイアスの軽減を目的とした,より適応性の高いベイジアンg-formula推定器を開発した。
具体的には,離散生存データに対するより一般的なg-formulaのクラスを導入し,縦バランススコアを組み込むことにより,次元減少の有効な方法となり,時間変化のある共同創設者の列を扱う上で重要であることを示す。
これらの時間的バランススコアの最小限の定式化は、静的か動的かにかかわらず、治療体制の性質に関係している。
各治療法について,BARTフレームワークを基盤とした後部サンプリングアルゴリズムを提案する。
本研究は,Yale New Haven Health System (YNHHS) の電子健康記録から得られたデータを用いて,提案手法の実証的性能を実証するためのシミュレーション研究を行った。
関連論文リスト
- Deep Learning Methods for the Noniterative Conditional Expectation G-Formula for Causal Inference from Complex Observational Data [3.0958655016140892]
g-formula は観測データを用いて持続的治療戦略の因果効果を推定するために用いられる。
パラメトリックモデルはモデルの誤特定を受けており、バイアスのある因果推定をもたらす可能性がある。
NICE g-formula 推定器のための統合型ディープラーニングフレームワークを提案する。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-10-28T21:00:46Z) - GenBench: A Benchmarking Suite for Systematic Evaluation of Genomic Foundation Models [56.63218531256961]
我々はGenomic Foundation Modelsの有効性を評価するためのベンチマークスイートであるGenBenchを紹介する。
GenBenchはモジュラーで拡張可能なフレームワークを提供し、様々な最先端の方法論をカプセル化している。
本稿では,タスク固有性能におけるモデルアーキテクチャとデータセット特性の相互作用のニュアンス解析を行う。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-06-01T08:01:05Z) - Modal Analysis of Spatiotemporal Data via Multivariate Gaussian Process Regression [0.0]
モーダル解析は複雑な流れのコヒーレントな構造を理解するための重要なツールとなっている。
データ不足と不規則サンプリングの限界を克服するために,新しいモーダル解析手法を提案する。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-03-19T19:47:02Z) - Inference of Dependency Knowledge Graph for Electronic Health Records [13.35941801610195]
動的対数線形トピックモデルに基づくスパース知識グラフの導出フレームワークを提案する。
このモデルでは、経験的ポイントワイド相互情報行列上で特異値分解を行うことにより、KG埋め込みを推定する。
次に、KG低ランク推定器のエントリーワイド正規度を確立し、制御されたI型誤差によるスパースグラフエッジの回復を可能にする。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-12-25T04:45:36Z) - Simulation-based Inference for Cardiovascular Models [57.92535897767929]
シミュレーションに基づく推論を用いて、波形をプラプシブルな生理的パラメータにマッピングする逆問題を解決する。
臨床応用5種類のバイオマーカーのin-silico不確実性解析を行った。
我々はMIMIC-III波形データベースを用いて,ビビオとシリカのギャップについて検討した。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-07-26T02:34:57Z) - Spatiotemporal Cardiac Statistical Shape Modeling: A Data-Driven
Approach [0.0]
粒子ベース形状モデリング(PSM)は、個体群レベルの形状変化を捉えたデータ駆動型手法である。
本稿では,PSM法にインスパイアされたデータ駆動型手法を提案する。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-09-06T18:00:45Z) - Continuous-Time Modeling of Counterfactual Outcomes Using Neural
Controlled Differential Equations [84.42837346400151]
反現実的な結果を予測することは、パーソナライズされたヘルスケアをアンロックする可能性がある。
既存の因果推論アプローチでは、観察と治療決定の間の通常の離散時間間隔が考慮されている。
そこで本研究では,腫瘍増殖モデルに基づく制御可能なシミュレーション環境を提案する。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-06-16T17:15:15Z) - Mixed Effects Neural ODE: A Variational Approximation for Analyzing the
Dynamics of Panel Data [50.23363975709122]
パネルデータ解析に(固定・ランダムな)混合効果を取り入れたME-NODEという確率モデルを提案する。
我々は、Wong-Zakai定理によって提供されるSDEの滑らかな近似を用いて、我々のモデルを導出できることを示す。
次に、ME-NODEのためのエビデンスに基づく下界を導出し、(効率的な)トレーニングアルゴリズムを開発する。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-02-18T22:41:51Z) - Deep Bayesian Estimation for Dynamic Treatment Regimes with a Long
Follow-up Time [28.11470886127216]
動的治療体制(DTR)の因果効果推定は、シーケンシャルな意思決定に寄与する。
結果回帰モデルと高次元特徴に対する治療モデルを組み合わせる。
また、開発されたディープベイズモデルでは、不確実性をモデル化し、自動運転車や医療設計など、安全に配慮したアプリケーションに不可欠な予測分散を出力することができる。
論文 参考訳(メタデータ) (2021-09-20T13:21:39Z) - Leveraging Global Parameters for Flow-based Neural Posterior Estimation [90.21090932619695]
実験観測に基づくモデルのパラメータを推定することは、科学的方法の中心である。
特に困難な設定は、モデルが強く不確定であるとき、すなわち、パラメータの異なるセットが同一の観測をもたらすときである。
本稿では,グローバルパラメータを共有する観測の補助的セットによって伝達される付加情報を利用して,その不確定性を破る手法を提案する。
論文 参考訳(メタデータ) (2021-02-12T12:23:13Z) - Stochastically forced ensemble dynamic mode decomposition for
forecasting and analysis of near-periodic systems [65.44033635330604]
本稿では,観測力学を強制線形系としてモデル化した新しい負荷予測手法を提案する。
固有線型力学の利用は、解釈可能性やパーシモニーの観点から、多くの望ましい性質を提供することを示す。
電力グリッドからの負荷データを用いたテストケースの結果が提示される。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-10-08T20:25:52Z)
関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。
指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト(すべての情報・翻訳含む)の品質を保証せず、本サイト(すべての情報・翻訳含む)を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。