論文の概要: Ten simple rules for teaching sustainable software engineering
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2402.04722v1
- Date: Wed, 7 Feb 2024 10:16:20 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-02-08 15:50:08.785727
- Title: Ten simple rules for teaching sustainable software engineering
- Title（参考訳）: 持続可能なソフトウェア工学を教えるための10の簡単なルール
- Authors: Kit Gallagher, Richard Creswell, Ben Lambert, Martin Robinson, Chon
Lok Lei, Gary R. Mirams, David J. Gavaghan
- Abstract要約: 高品質な研究ソフトウェアを開発するには、多くのソフトウェア開発スキルを開発する必要がある。
計算研究における基礎的・優れた開発プラクティスの確保に重点が置かれている。
10 Simple Rulesコレクションの最近の記事は、生物学の学生にコンピュータサイエンスとコーディング技術の教育について論じている。
我々は、科学者が持続可能なソフトウェアパッケージを開発するために必要なスキルを効果的に教えるための具体的な手順を説明することによって、この議論を進める。
- 参考スコア（独自算出の注目度）: 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Computational methods and associated software implementations are central to
every field of scientific investigation. Modern biological research,
particularly within systems biology, has relied heavily on the development of
software tools to process and organize increasingly large datasets, simulate
complex mechanistic models, provide tools for the analysis and management of
data, and visualize and organize outputs. However, developing high-quality
research software requires scientists to develop a host of software development
skills, and teaching these skills to students is challenging. There has been a
growing importance placed on ensuring reproducibility and good development
practices in computational research. However, less attention has been devoted
to informing the specific teaching strategies which are effective at nurturing
in researchers the complex skillset required to produce high-quality software
that, increasingly, is required to underpin both academic and industrial
biomedical research. Recent articles in the Ten Simple Rules collection have
discussed the teaching of foundational computer science and coding techniques
to biology students. We advance this discussion by describing the specific
steps for effectively teaching the necessary skills scientists need to develop
sustainable software packages which are fit for (re-)use in academic research
or more widely. Although our advice is likely to be applicable to all students
and researchers hoping to improve their software development skills, our
guidelines are directed towards an audience of students that have some
programming literacy but little formal training in software development or
engineering, typical of early doctoral students. These practices are also
applicable outside of doctoral training environments, and we believe they
should form a key part of postgraduate training schemes more generally in the
life sciences.
- Abstract（参考訳）: 計算手法と関連するソフトウェア実装は、科学研究のあらゆる分野の中心である。
現代の生物学研究は、特にシステム生物学において、ますます大規模なデータセットの処理と編成、複雑な力学モデルのシミュレート、データの分析と管理のためのツールの提供、出力の可視化と編成のためのソフトウェアツールの開発に大きく依存している。
しかし、高品質な研究ソフトウェアを開発するためには、多くのソフトウェア開発スキルを開発する必要がある。
計算研究における再現性と優れた開発プラクティスの確保に重点が置かれている。
しかし、研究者の育成に有効な特定の教育戦略に、高品質なソフトウェアを作るために必要な複雑なスキルセットを伝えることにはあまり注意が払われておらず、学術的・工業的なバイオメディカル研究の基盤となることがますます求められている。
ten simple rules collectionの最近の論文では、生物学の学生に対する基礎的コンピュータ科学とコーディング技術の教育について論じられている。
我々は、科学者が学術研究に適合する(再利用可能な)持続可能なソフトウェアパッケージを開発するために必要なスキルを効果的に教えるための具体的なステップを説明することによって、この議論を進めます。
私たちのアドバイスは、ソフトウェア開発スキルの向上を望むすべての学生や研究者に当てはまる可能性が高いが、我々のガイドラインは、初期の博士課程の学生の典型的な、プログラムリテラシーはあるがソフトウェア開発やエンジニアリングの正式なトレーニングがほとんどない学生の聴衆に向けられている。
これらのプラクティスは、博士課程のトレーニング環境以外でも適用可能であり、より一般的に生命科学において、大学院のトレーニングスキームの重要な部分を形成するべきだと考えています。
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