論文の概要: Automated Classification of Body MRI Sequence Type Using Convolutional
Neural Networks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2402.08098v1
- Date: Mon, 12 Feb 2024 22:34:57 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-02-14 17:18:59.664031
- Title: Automated Classification of Body MRI Sequence Type Using Convolutional
Neural Networks
- Title(参考訳): 畳み込みニューラルネットワークを用いた身体MRI系列型の自動分類
- Authors: Kimberly Helm, Tejas Sudharshan Mathai, Boah Kim, Pritam Mukherjee,
Jianfei Liu, Ronald M. Summers
- Abstract要約: 胸部,腹部,骨盤のレベルで得られた3次元MRIの配列を自動分類する方法を提案する。
われわれは,胸部,腹部,骨盤のMRI画像の3次元分類法を初めて開発した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.734037486455235
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Multi-parametric MRI of the body is routinely acquired for the identification
of abnormalities and diagnosis of diseases. However, a standard naming
convention for the MRI protocols and associated sequences does not exist due to
wide variations in imaging practice at institutions and myriad MRI scanners
from various manufacturers being used for imaging. The intensity distributions
of MRI sequences differ widely as a result, and there also exists information
conflicts related to the sequence type in the DICOM headers. At present,
clinician oversight is necessary to ensure that the correct sequence is being
read and used for diagnosis. This poses a challenge when specific series need
to be considered for building a cohort for a large clinical study or for
developing AI algorithms. In order to reduce clinician oversight and ensure the
validity of the DICOM headers, we propose an automated method to classify the
3D MRI sequence acquired at the levels of the chest, abdomen, and pelvis. In
our pilot work, our 3D DenseNet-121 model achieved an F1 score of 99.5% at
differentiating 5 common MRI sequences obtained by three Siemens scanners
(Aera, Verio, Biograph mMR). To the best of our knowledge, we are the first to
develop an automated method for the 3D classification of MRI sequences in the
chest, abdomen, and pelvis, and our work has outperformed the previous
state-of-the-art MRI series classifiers.
- Abstract(参考訳): 異常の同定と疾患の診断のために、身体のマルチパラメトリックMRIが定期的に取得される。
しかし、MRIプロトコルや関連配列の標準的な命名規則は、様々なメーカーのMRIスキャナーが画像撮影に使われている施設でのイメージングの実践の幅広いバリエーションのために存在しない。
その結果、MRIシーケンスの強度分布は様々であり、DICOMヘッダのシーケンスタイプに関連する情報競合も存在する。
現在、正しいシーケンスを読み取り、診断に使用するためには、臨床医の監視が必要である。
これは、大規模な臨床研究のためのコホートを構築するために、あるいはAIアルゴリズムを開発するために、特定のシリーズを考える必要がある場合、課題となる。
dicomヘッダーの有効性を確保するために,胸部,腹部,骨盤のレベルで獲得した3次元mriシーケンスを自動分類する手法を提案する。
我々の3D DenseNet-121モデルは、3つのシーメンススキャナー(Aera, Verio, Biograph mMR)で得られた5つのMRIシークエンスを区別し、99.5%のF1スコアを得た。
私たちの知る限りでは、胸部、腹部、骨盤のmriシーケンスを3次元に分類する自動化手法を最初に開発し、これまでの最先端のmri系列分類器よりも優れています。
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