論文の概要: latrend: A Framework for Clustering Longitudinal Data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2402.14621v1
- Date: Thu, 22 Feb 2024 15:09:13 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-02-23 14:41:57.816588
- Title: latrend: A Framework for Clustering Longitudinal Data
- Title(参考訳): latrend: 縦断データをクラスタリングするためのフレームワーク
- Authors: Niek Den Teuling, Steffen Pauws, Edwin van den Heuvel
- Abstract要約: 縦クラスタリングのためのメソッドの統一的な適用のためのフレームワークとして,Rパッケージ"latrend"を紹介した。
dtwclust"、"flexmix"、"kml"、"lcmm"、"mclust"、"mixAK"、"mixtools"などの長手データのクラスタリングに使われるパッケージのインターフェースとしても機能する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
- Abstract: Clustering of longitudinal data is used to explore common trends among
subjects over time for a numeric measurement of interest. Various R packages
have been introduced throughout the years for identifying clusters of
longitudinal patterns, summarizing the variability in trajectories between
subject in terms of one or more trends. We introduce the R package "latrend" as
a framework for the unified application of methods for longitudinal clustering,
enabling comparisons between methods with minimal coding. The package also
serves as an interface to commonly used packages for clustering longitudinal
data, including "dtwclust", "flexmix", "kml", "lcmm", "mclust", "mixAK", and
"mixtools". This enables researchers to easily compare different approaches,
implementations, and method specifications. Furthermore, researchers can build
upon the standard tools provided by the framework to quickly implement new
cluster methods, enabling rapid prototyping. We demonstrate the functionality
and application of the latrend package on a synthetic dataset based on the
therapy adherence patterns of patients with sleep apnea.
- Abstract(参考訳): 縦断データのクラスタリングは、興味の数値測定のために時間とともに被験者間の共通傾向を探索するために使われる。
様々なRパッケージが長年にわたって導入され、1つ以上の傾向から、被験者間の軌跡の変動を要約し、縦パターンのクラスタを識別している。
本稿では,R パッケージ "latrend" を長手クラスタリング手法の統一的適用のためのフレームワークとして導入し,最小限の符号化方式との比較を可能にする。
このパッケージは、"dtwclust"、"flexmix"、"kml"、"lcmm"、"mclust"、"mixak"、"mixtools"など、縦断データをクラスタリングするための一般的なパッケージのインターフェースとしても機能する。
これにより、研究者は異なるアプローチ、実装、メソッド仕様を簡単に比較できる。
さらに、研究者はフレームワークが提供する標準ツールを利用して、新しいクラスタメソッドを迅速に実装し、迅速なプロトタイピングを可能にする。
睡眠時無呼吸患者の治療適応パターンに基づく合成データセットにおけるラトレンドパッケージの機能と応用を実証した。
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