論文の概要: How we won BraTS 2023 Adult Glioma challenge? Just faking it! Enhanced Synthetic Data Augmentation and Model Ensemble for brain tumour segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2402.17317v2
- Date: Wed, 17 Jul 2024 14:47:18 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-07-18 22:39:10.132335
- Title: How we won BraTS 2023 Adult Glioma challenge? Just faking it! Enhanced Synthetic Data Augmentation and Model Ensemble for brain tumour segmentation
- Title(参考訳): 成人グリオーマにおけるBraTS 2023の勝利
- Authors: André Ferreira, Naida Solak, Jianning Li, Philipp Dammann, Jens Kleesiek, Victor Alves, Jan Egger,
- Abstract要約: ディープラーニングは、脳腫瘍をセグメント化するための最先端技術である。
大量の高品質なデータが必要ですが、入手は困難です。
我々は、データ拡張に非従来的なメカニズムを用いることで、この問題に対処する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.063757582116522
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Deep Learning is the state-of-the-art technology for segmenting brain tumours. However, this requires a lot of high-quality data, which is difficult to obtain, especially in the medical field. Therefore, our solutions address this problem by using unconventional mechanisms for data augmentation. Generative adversarial networks and registration are used to massively increase the amount of available samples for training three different deep learning models for brain tumour segmentation, the first task of the BraTS2023 challenge. The first model is the standard nnU-Net, the second is the Swin UNETR and the third is the winning solution of the BraTS 2021 Challenge. The entire pipeline is built on the nnU-Net implementation, except for the generation of the synthetic data. The use of convolutional algorithms and transformers is able to fill each other's knowledge gaps. Using the new metric, our best solution achieves the dice results 0.9005, 0.8673, 0.8509 and HD95 14.940, 14.467, 17.699 (whole tumour, tumour core and enhancing tumour) in the validation set.
- Abstract(参考訳): Deep Learningは、脳腫瘍をセグメント化するための最先端技術である。
しかし、これは多くの高品質なデータを必要としており、特に医療分野では入手が困難である。
そこで本研究では,データ拡張のための非従来的メカニズムを用いてこの問題に対処する。
生成的敵ネットワークと登録は、BraTS2023チャレンジの最初のタスクである脳腫瘍セグメンテーションのための3つの異なるディープラーニングモデルをトレーニングするための利用可能なサンプルの量を大幅に増やすために使用される。
最初のモデルは標準のnnU-Net、2番目はSwin UNETR、3番目はBraTS 2021 Challengeの勝利のソリューションである。
パイプライン全体は、合成データの生成を除いて、nnU-Net実装に基づいて構築されている。
畳み込みアルゴリズムと変圧器は互いの知識ギャップを埋めることができる。
新しい測定値を用いて, 有効解法は, 検証セットで0.9005, 0.8673, 0.8509, HD95 14.940, 14.467, 17.699 (全腫瘍, 腫瘍コア, 造影腫瘍) が得られる。
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