論文の概要: Region-based U-net for accelerated training and enhanced precision in deep brain segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2403.09414v1
- Date: Thu, 14 Mar 2024 14:04:29 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-03-15 20:17:36.905875
- Title: Region-based U-net for accelerated training and enhanced precision in deep brain segmentation
- Title(参考訳): 深部脳分節訓練における領域ベースU-netの高速化と精度向上
- Authors: Mengyu Li, Magnus Magnusson, Thilo van Eimeren, Lotta M. Ellingsen,
- Abstract要約: 本稿では,12の深層脳構造に対する深層学習に基づくセグメンテーション手法を提案する。
提案手法は平均Dice similarity Coefficient (DSC) 0.901, 95% Hausdorff Distance (HD95) 1.155mmの精度で得られた。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.9874634324357792
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Segmentation of brain structures on MRI is the primary step for further quantitative analysis of brain diseases. Manual segmentation is still considered the gold standard in terms of accuracy; however, such data is extremely time-consuming to generate. This paper presents a deep learning-based segmentation approach for 12 deep-brain structures, utilizing multiple region-based U-Nets. The brain is divided into three focal regions of interest that encompass the brainstem, the ventricular system, and the striatum. Next, three region-based U-nets are run in parallel to parcellate these larger structures into their respective four substructures. This approach not only greatly reduces the training and processing times but also significantly enhances the segmentation accuracy, compared to segmenting the entire MRI image at once. Our approach achieves remarkable accuracy with an average Dice Similarity Coefficient (DSC) of 0.901 and 95% Hausdorff Distance (HD95) of 1.155 mm. The method was compared with state-of-the-art segmentation approaches, demonstrating a high level of accuracy and robustness of the proposed method.
- Abstract(参考訳): MRIにおける脳構造の分離は、脳疾患のさらなる定量的解析の第一ステップである。
手動のセグメンテーションは依然として正確性の観点からは金の標準と見なされているが、そのようなデータは生成に非常に時間がかかる。
本稿では,12の深層脳構造に対する深層学習に基づくセグメンテーション手法を提案する。
脳は脳幹、心室系、線条体を含む3つの焦点領域に分けられる。
次に、これらの大きな構造をそれぞれの4つのサブ構造に解析するために、3つのリージョンベースのU-netが並列に実行される。
このアプローチは、トレーニングや処理時間を大幅に短縮するだけでなく、MRI画像全体を一度にセグメント化するよりも、セグメント化の精度を大幅に向上させる。
提案手法は平均Dice similarity Coefficient (DSC) 0.901, 95% Hausdorff Distance (HD95) 1.155mmの精度で得られた。
本手法は最先端のセグメンテーション手法と比較し,提案手法の精度とロバスト性を示した。
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