論文の概要: Molecular Classification Using Hyperdimensional Graph Classification
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2403.12307v1
- Date: Mon, 18 Mar 2024 23:16:17 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-03-20 17:52:34.478000
- Title: Molecular Classification Using Hyperdimensional Graph Classification
- Title(参考訳): 超次元グラフ分類を用いた分子分類
- Authors: Pere Verges, Igor Nunes, Mike Heddes, Tony Givargis, Alexandru Nicolau,
- Abstract要約: この研究は超次元コンピューティングを利用してグラフ学習に革新的なアプローチを導入する。
この領域における重要な応用は、様々な分子構造にまたがるがん細胞の同定である。
グラフニューラルネットワーク(GNN)やWeisfieler-Lehmanグラフカーネル(WL)のような最先端のモデルと比較して,曲線の下の面積を比較検討したHDCモデルを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 41.38562343472387
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Our work introduces an innovative approach to graph learning by leveraging Hyperdimensional Computing. Graphs serve as a widely embraced method for conveying information, and their utilization in learning has gained significant attention. This is notable in the field of chemoinformatics, where learning from graph representations plays a pivotal role. An important application within this domain involves the identification of cancerous cells across diverse molecular structures. We propose an HDC-based model that demonstrates comparable Area Under the Curve results when compared to state-of-the-art models like Graph Neural Networks (GNNs) or the Weisfieler-Lehman graph kernel (WL). Moreover, it outperforms previously proposed hyperdimensional computing graph learning methods. Furthermore, it achieves noteworthy speed enhancements, boasting a 40x acceleration in the training phase and a 15x improvement in inference time compared to GNN and WL models. This not only underscores the efficacy of the HDC-based method, but also highlights its potential for expedited and resource-efficient graph learning.
- Abstract(参考訳): 我々の研究は超次元コンピューティングを活用したグラフ学習の革新的アプローチを導入している。
グラフは情報伝達のための広く受け入れられた手法であり,その学習における利用が注目されている。
これは、グラフ表現からの学習が重要な役割を果たすケモインフォマティクスの分野において顕著である。
この領域における重要な応用は、様々な分子構造にまたがるがん細胞の同定である。
本稿では,グラフニューラルネットワーク (GNN) やWeisfieler-Lehmanグラフカーネル (WL) のような最先端のモデルと比較して,曲線の下の面積を比較検討する。
さらに,従来の超次元計算グラフ学習法よりも優れていた。
さらに、トレーニングフェーズの40倍の高速化と、GNNやWLモデルと比較して15倍の推論時間向上を実現している。
このことはHDCベースの手法の有効性を裏付けるだけでなく、高速かつ資源効率の高いグラフ学習の可能性も強調している。
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