論文の概要: High-confidence pseudo-labels for domain adaptation in COVID-19 detection
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2403.13509v1
- Date: Wed, 20 Mar 2024 11:12:57 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-03-21 17:07:38.339776
- Title: High-confidence pseudo-labels for domain adaptation in COVID-19 detection
- Title(参考訳): 新型コロナウイルス検出におけるドメイン適応のための高信頼擬似ラベル
- Authors: Robert Turnbull, Simon Mutch,
- Abstract要約: 本報告では,第4回COV19Dコンペティションへの応募について概説する。
競技は2つの課題からなる。
1つ目は、COV19-CT-DBデータベースから1000以上のCTスキャンから新型コロナウイルスの存在を検出するために分類器を訓練することである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.28720658988688
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: This paper outlines our submission for the 4th COV19D competition as part of the `Domain adaptation, Explainability, Fairness in AI for Medical Image Analysis' (DEF-AI-MIA) workshop at the Computer Vision and Pattern Recognition Conference (CVPR). The competition consists of two challenges. The first is to train a classifier to detect the presence of COVID-19 from over one thousand CT scans from the COV19-CT-DB database. The second challenge is to perform domain adaptation by taking the dataset from Challenge 1 and adding a small number of scans (some annotated and other not) for a different distribution. We preprocessed the CT scans to segment the lungs, and output volumes with the lungs individually and together. We then trained 3D ResNet and Swin Transformer models on these inputs. We annotated the unlabeled CT scans using an ensemble of these models and chose the high-confidence predictions as pseudo-labels for fine-tuning. This resulted in a best cross-validation mean F1 score of 93.39\% for Challenge 1 and a mean F1 score of 92.15 for Challenge 2.
- Abstract(参考訳): 本稿では,コンピュータビジョン・パターン認識会議(CVPR)におけるDEF-AI-MIAワークショップの一環として,第4回COV19Dコンペティションへの応募について概説する。
競技は2つの課題からなる。
1つ目は、COV19-CT-DBデータベースから1000以上のCTスキャンから新型コロナウイルスの存在を検出するために分類器を訓練することである。
第2の課題は、データセットをチャレンジ1から取得し、異なるディストリビューションに少数のスキャン(注釈付きなど)を追加することで、ドメイン適応を実行することだ。
我々はCTスキャンを前処理して肺を分画し,肺を個別に出力した。
次に、これらの入力に基づいて3D ResNetとSwin Transformerモデルをトレーニングした。
我々はこれらのモデルのアンサンブルを用いてラベルなしCTスキャンに注釈を付け,高信頼度予測を微調整用擬似ラベルとして選択した。
その結果、チャレンジ1の平均F1スコアは93.39\%、チャレンジ2の平均F1スコアは92.15となった。
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