論文の概要: HealthGAT: Node Classifications in Electronic Health Records using Graph Attention Networks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2403.18128v1
- Date: Tue, 26 Mar 2024 22:17:01 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-03-28 20:55:22.655432
- Title: HealthGAT: Node Classifications in Electronic Health Records using Graph Attention Networks
- Title(参考訳): HealthGAT:グラフ注意ネットワークを用いた電子健康記録のノード分類
- Authors: Fahmida Liza Piya, Mehak Gupta, Rahmatollah Beheshti,
- Abstract要約: HealthGATは、EHRから埋め込みを生成するグラフアテンションネットワークフレームワークである。
本モデルでは,医療コードへの埋め込みを反復的に洗練し,EHRデータ解析の改善を実現している。
本モデルでは,ノード分類や,可読度予測や診断分類などの下流タスクにおいて,優れた性能を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.2026317523029193
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: While electronic health records (EHRs) are widely used across various applications in healthcare, most applications use the EHRs in their raw (tabular) format. Relying on raw or simple data pre-processing can greatly limit the performance or even applicability of downstream tasks using EHRs. To address this challenge, we present HealthGAT, a novel graph attention network framework that utilizes a hierarchical approach to generate embeddings from EHR, surpassing traditional graph-based methods. Our model iteratively refines the embeddings for medical codes, resulting in improved EHR data analysis. We also introduce customized EHR-centric auxiliary pre-training tasks to leverage the rich medical knowledge embedded within the data. This approach provides a comprehensive analysis of complex medical relationships and offers significant advancement over standard data representation techniques. HealthGAT has demonstrated its effectiveness in various healthcare scenarios through comprehensive evaluations against established methodologies. Specifically, our model shows outstanding performance in node classification and downstream tasks such as predicting readmissions and diagnosis classifications. Our code is available at https://github.com/healthylaife/HealthGAT
- Abstract(参考訳): 電子健康記録(EHR)は医療における様々な用途で広く使われているが、ほとんどのアプリケーションは生の(タブラル)フォーマットでEHRを使用する。
生データや単純なデータ前処理を頼りにすることで、EHRを使用した下流タスクのパフォーマンスや適用性を大幅に制限することができる。
この課題に対処するために、従来のグラフベースの手法を超越した、階層的なアプローチでEHRから埋め込みを生成する新しいグラフアテンションネットワークフレームワークHealthGATを提案する。
本モデルでは,医療コードへの埋め込みを反復的に洗練し,EHRデータ解析の改善を実現している。
また、データに埋め込まれた豊富な医療知識を活用するために、カスタマイズされたEMH中心の補助訓練タスクも導入する。
このアプローチは、複雑な医療関係を包括的に分析し、標準データ表現技術よりも大幅に進歩する。
HealthGATは、確立した方法論に対する包括的な評価を通じて、様々な医療シナリオにおいてその効果を実証してきた。
具体的には,ノード分類や,可読度予測や診断分類などの下流タスクにおいて,優れた性能を示す。
私たちのコードはhttps://github.com/healthylaife/HealthGATで利用可能です。
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