論文の概要: LaTiM: Longitudinal representation learning in continuous-time models to predict disease progression
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2404.07091v1
- Date: Wed, 10 Apr 2024 15:29:29 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-04-11 14:11:27.395278
- Title: LaTiM: Longitudinal representation learning in continuous-time models to predict disease progression
- Title(参考訳): LaTiM:病気進行予測のための連続時間モデルにおける縦方向表現学習
- Authors: Rachid Zeghlache, Pierre-Henri Conze, Mostafa El Habib Daho, Yihao Li, Hugo Le Boité, Ramin Tadayoni, Pascal Massin, Béatrice Cochener, Alireza Rezaei, Ikram Brahim, Gwenolé Quellec, Mathieu Lamard,
- Abstract要約: 本研究では、時間認識型ニューラル常微分方程式(NODE)を用いた疾患進行解析のための新しい枠組みを提案する。
自己教師付き学習(SSL)によって訓練されたフレームワークに"タイムアウェアヘッド"を導入し、データ拡張のために潜時空間における時間情報を活用する。
OPHDIATデータベースを用いた糖尿病網膜症進行予測法の有効性を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.663690023739801
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: This work proposes a novel framework for analyzing disease progression using time-aware neural ordinary differential equations (NODE). We introduce a "time-aware head" in a framework trained through self-supervised learning (SSL) to leverage temporal information in latent space for data augmentation. This approach effectively integrates NODEs with SSL, offering significant performance improvements compared to traditional methods that lack explicit temporal integration. We demonstrate the effectiveness of our strategy for diabetic retinopathy progression prediction using the OPHDIAT database. Compared to the baseline, all NODE architectures achieve statistically significant improvements in area under the ROC curve (AUC) and Kappa metrics, highlighting the efficacy of pre-training with SSL-inspired approaches. Additionally, our framework promotes stable training for NODEs, a commonly encountered challenge in time-aware modeling.
- Abstract(参考訳): 本研究では、時間認識型ニューラル常微分方程式(NODE)を用いて、疾患の進行を解析するための新しい枠組みを提案する。
自己教師付き学習(SSL)によって訓練されたフレームワークに"タイムアウェアヘッド"を導入し、データ拡張のために潜時空間における時間情報を活用する。
このアプローチはNODEをSSLと効果的に統合し、明示的な時間的統合が欠如している従来のメソッドと比較して、大幅なパフォーマンス向上を実現している。
OPHDIATデータベースを用いた糖尿病網膜症進行予測法の有効性を示す。
ベースラインと比較して、すべてのNODEアーキテクチャは、ROC曲線(AUC)とKappaメトリクスの領域において統計的に有意な改善を達成し、SSLにインスパイアされたアプローチによる事前トレーニングの有効性を強調した。
さらに、我々のフレームワークは、時間認識モデリングにおいて一般的に直面する課題であるNODEの安定したトレーニングを促進する。
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