論文の概要: Language Interaction Network for Clinical Trial Approval Estimation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2405.06662v1
- Date: Fri, 26 Apr 2024 14:50:59 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-05-27 03:27:39.876630
- Title: Language Interaction Network for Clinical Trial Approval Estimation
- Title(参考訳): 治験承認評価のための言語相互作用ネットワーク
- Authors: Chufan Gao, Tianfan Fu, Jimeng Sun,
- Abstract要約: 本稿では,言語相互作用ネットワーク(LINT, Language Interaction Network)について紹介する。
臨床治験の3段階にわたって厳格にLINTを試験し,ROC-AUCスコアは0.770,0.740,0.748となった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 37.60098683485169
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Clinical trial outcome prediction seeks to estimate the likelihood that a clinical trial will successfully reach its intended endpoint. This process predominantly involves the development of machine learning models that utilize a variety of data sources such as descriptions of the clinical trials, characteristics of the drug molecules, and specific disease conditions being targeted. Accurate predictions of trial outcomes are crucial for optimizing trial planning and prioritizing investments in a drug portfolio. While previous research has largely concentrated on small-molecule drugs, there is a growing need to focus on biologics-a rapidly expanding category of therapeutic agents that often lack the well-defined molecular properties associated with traditional drugs. Additionally, applying conventional methods like graph neural networks to biologics data proves challenging due to their complex nature. To address these challenges, we introduce the Language Interaction Network (LINT), a novel approach that predicts trial outcomes using only the free-text descriptions of the trials. We have rigorously tested the effectiveness of LINT across three phases of clinical trials, where it achieved ROC-AUC scores of 0.770, 0.740, and 0.748 for phases I, II, and III, respectively, specifically concerning trials involving biologic interventions.
- Abstract(参考訳): 臨床試験結果の予測は、臨床試験がその目的のエンドポイントに到達する確率を見積もる。
このプロセスは主に、臨床試験の記述、薬物分子の特徴、標的とする特定の疾患状態など、さまざまなデータソースを利用する機械学習モデルの開発を含む。
試験結果の正確な予測は、試験計画の最適化と薬物ポートフォリオへの投資の優先順位付けに不可欠である。
これまでの研究は、主に小分子の薬物に焦点を合わせてきたが、従来の薬物に関連する分子的特性を欠く治療薬の急速に普及するカテゴリーである生物学に焦点を絞る必要性が高まっている。
さらに、グラフニューラルネットワークのような従来の手法を生物学的データに適用することは、その複雑な性質のために困難であることが証明されている。
これらの課題に対処するために,実験の自由テキスト記述のみを用いて実験結果を予測する新しいアプローチであるLINT(Language Interaction Network)を導入する。
臨床治験の3段階にわたるLINTの有効性を精力的に検証し, 生物学的介入を含む臨床試験に関して, それぞれ0.770, 0.740, 0.748のROC-AUCスコアを得た。
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