論文の概要: A Large-scale Multi Domain Leukemia Dataset for the White Blood Cells Detection with Morphological Attributes for Explainability
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2405.10803v1
- Date: Fri, 17 May 2024 14:20:02 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-05-20 15:53:32.556892
- Title: A Large-scale Multi Domain Leukemia Dataset for the White Blood Cells Detection with Morphological Attributes for Explainability
- Title(参考訳): 形態的属性による白血球検出のための大規模多ドメイン白血病データセット
- Authors: Abdul Rehman, Talha Meraj, Aiman Mahmood Minhas, Ayisha Imran, Mohsen Ali, Waqas Sultani,
- Abstract要約: 白血球の予後は白血球の形態的情報なしでは困難である
深層学習に基づく手法は、血液学者を支援するために用いられる。
私たちは現実的で、一般化され、大規模なデータセットを取得しました。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.6197612404154285
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Earlier diagnosis of Leukemia can save thousands of lives annually. The prognosis of leukemia is challenging without the morphological information of White Blood Cells (WBC) and relies on the accessibility of expensive microscopes and the availability of hematologists to analyze Peripheral Blood Samples (PBS). Deep Learning based methods can be employed to assist hematologists. However, these algorithms require a large amount of labeled data, which is not readily available. To overcome this limitation, we have acquired a realistic, generalized, and large dataset. To collect this comprehensive dataset for real-world applications, two microscopes from two different cost spectrums (high-cost HCM and low-cost LCM) are used for dataset capturing at three magnifications (100x, 40x, 10x) through different sensors (high-end camera for HCM, middle-level camera for LCM and mobile-phone camera for both). The high-sensor camera is 47 times more expensive than the middle-level camera and HCM is 17 times more expensive than LCM. In this collection, using HCM at high resolution (100x), experienced hematologists annotated 10.3k WBC types (14) and artifacts, having 55k morphological labels (Cell Size, Nuclear Chromatin, Nuclear Shape, etc.) from 2.4k images of several PBS leukemia patients. Later on, these annotations are transferred to other 2 magnifications of HCM, and 3 magnifications of LCM, and on each camera captured images. Along with the LeukemiaAttri dataset, we provide baselines over multiple object detectors and Unsupervised Domain Adaptation (UDA) strategies, along with morphological information-based attribute prediction. The dataset will be publicly available after publication to facilitate the research in this direction.
- Abstract(参考訳): 白血病の早期診断は毎年数千人の命を救える。
白血病の予後は、白血球(WBC)の形態情報なしでは困難であり、高価な顕微鏡のアクセシビリティと、末梢血サンプル(PBS)の分析に血液学者が利用できることに依存している。
深層学習に基づく手法は、血液学者を支援するために用いられる。
しかし、これらのアルゴリズムは大量のラベル付きデータを必要とするため、簡単には利用できない。
この制限を克服するため、私たちは現実的で、一般化され、大きなデータセットを取得しました。
この総合的なデータセットを現実世界の応用のために収集するために、異なるセンサー(HCM用のハイエンドカメラ、CM用のミドルレベルのカメラ、両方の携帯電話カメラ)を通して3つの倍率(100倍、40倍、10倍)で撮影するために、2つの異なるコストスペクトル(高コストのHCMと低コストのLCM)から2つの顕微鏡が使用される。
高感度カメラは中級カメラの47倍高く、HCMはLCMの17倍高い。
このコレクションでは、HCMを高分解能(100倍)で使用し、いくつかのPBS白血病患者の2.4k画像から55kの形態ラベル(セルサイズ、核クロマチン、核形状など)を持つ10.3kのWBCタイプ(14)とアーティファクトを注釈付けした。
その後、これらのアノテーションはHCMの他の2倍、LCMの3倍、各カメラが撮影した画像に転送される。
LeukemiaAttriデータセットとともに、形態情報に基づく属性予測とともに、複数のオブジェクト検出器とUnsupervised Domain Adaptation (UDA)戦略のベースラインを提供します。
データセットは公開後に公開され、この方向の研究を促進する。
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