論文の概要: Probabilistic Temporal Prediction of Continuous Disease Trajectories and Treatment Effects Using Neural SDEs
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2406.12807v1
- Date: Tue, 18 Jun 2024 17:22:55 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-06-19 17:49:20.181073
- Title: Probabilistic Temporal Prediction of Continuous Disease Trajectories and Treatment Effects Using Neural SDEs
- Title(参考訳): 持続性疾患軌跡の確率的時間予測とニューラルSDEによる治療効果
- Authors: Joshua Durso-Finley, Berardino Barile, Jean-Pierre Falet, Douglas L. Arnold, Nick Pawlowski, Tal Arbel,
- Abstract要約: 神経差分方程式(NSDE)による疾患進行の持続的時間的進化をモデル化するための最初の因果時間的枠組みを提示する。
本研究は,将来のMS障害(EDSSなど)と治療効果を正確に予測するための,不確実性に基づく因果学習(DL)モデルとして,最初の成功例を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.5527554277858275
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Personalized medicine based on medical images, including predicting future individualized clinical disease progression and treatment response, would have an enormous impact on healthcare and drug development, particularly for diseases (e.g. multiple sclerosis (MS)) with long term, complex, heterogeneous evolutions and no cure. In this work, we present the first stochastic causal temporal framework to model the continuous temporal evolution of disease progression via Neural Stochastic Differential Equations (NSDE). The proposed causal inference model takes as input the patient's high dimensional images (MRI) and tabular data, and predicts both factual and counterfactual progression trajectories on different treatments in latent space. The NSDE permits the estimation of high-confidence personalized trajectories and treatment effects. Extensive experiments were performed on a large, multi-centre, proprietary dataset of patient 3D MRI and clinical data acquired during several randomized clinical trials for MS treatments. Our results present the first successful uncertainty-based causal Deep Learning (DL) model to: (a) accurately predict future patient MS disability evolution (e.g. EDSS) and treatment effects leveraging baseline MRI, and (b) permit the discovery of subgroups of patients for which the model has high confidence in their response to treatment even in clinical trials which did not reach their clinical endpoints.
- Abstract(参考訳): 医療画像に基づくパーソナライズド医療は、将来の個別化臨床疾患の進行と治療反応を予測し、特に長期、複雑で異質な進化と治療法のない疾患(例えば多発性硬化症(MS))に対して、医療と薬物開発に大きな影響を与える。
本研究では,神経確率微分方程式(NSDE)を用いて,疾患進行の持続的時間的進化をモデル化するための最初の確率因果時間的枠組みを示す。
提案した因果推論モデルは,患者の高次元画像(MRI)と表型データを入力として,潜時空間の異なる治療における現実的および対実的進行軌跡を予測する。
NSDEは信頼性の高いパーソナライズされた軌道の推定と治療効果を許可する。
患者3次元MRIとMS治療のためのランダム化臨床試験で得られた臨床データを、多中心でプロプライエタリなデータセットを用いて、広範囲にわたる実験を行った。
以上の結果から,不確実性に基づく因果ディープラーニング(DL)モデルの最初の成功例が示唆された。
(a) 将来のMS障害の進展(例えばEDSS)とベースラインMRIによる治療効果を正確に予測し、
b) 臨床的エンドポイントに届かなかった臨床試験においても, モデルが治療に対する反応に高い信頼性を有する患者のサブグループを発見できる。
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