論文の概要: BISeizuRe: BERT-Inspired Seizure Data Representation to Improve Epilepsy Monitoring
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2406.19189v1
- Date: Thu, 27 Jun 2024 14:09:10 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-06-28 13:58:17.815425
- Title: BISeizuRe: BERT-Inspired Seizure Data Representation to Improve Epilepsy Monitoring
- Title(参考訳): BISeizure: BERTにインスパイアされたてんかんモニタリングを改善するセイズールデータ表現
- Authors: Luca Benfenati, Thorir Mar Ingolfsson, Andrea Cossettini, Daniele Jahier Pagliari, Alessio Burrello, Luca Benini,
- Abstract要約: 本研究では,BERTモデルを用いた脳波による発作検出の新しい手法を提案する。
BENDRは2段階のトレーニングプロセス、事前トレーニング、微調整を行う。
最適化されたモデルでは性能が大幅に向上し、0.23 FP/h、2.5$times$はベースラインモデルよりも低く、感度は低いが許容できる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 13.35453284825286
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: This study presents a novel approach for EEG-based seizure detection leveraging a BERT-based model. The model, BENDR, undergoes a two-phase training process. Initially, it is pre-trained on the extensive Temple University Hospital EEG Corpus (TUEG), a 1.5 TB dataset comprising over 10,000 subjects, to extract common EEG data patterns. Subsequently, the model is fine-tuned on the CHB-MIT Scalp EEG Database, consisting of 664 EEG recordings from 24 pediatric patients, of which 198 contain seizure events. Key contributions include optimizing fine-tuning on the CHB-MIT dataset, where the impact of model architecture, pre-processing, and post-processing techniques are thoroughly examined to enhance sensitivity and reduce false positives per hour (FP/h). We also explored custom training strategies to ascertain the most effective setup. The model undergoes a novel second pre-training phase before subject-specific fine-tuning, enhancing its generalization capabilities. The optimized model demonstrates substantial performance enhancements, achieving as low as 0.23 FP/h, 2.5$\times$ lower than the baseline model, with a lower but still acceptable sensitivity rate, showcasing the effectiveness of applying a BERT-based approach on EEG-based seizure detection.
- Abstract(参考訳): 本研究では,BERTモデルを用いた脳波による発作検出の新しい手法を提案する。
モデルであるBENDRは、2フェーズのトレーニングプロセスを実行している。
当初は1万人以上の被験者からなる1.5TBデータセットである、テンプル大学病院脳波コーパス(TUEG)で事前トレーニングが行われ、一般的な脳波データパターンを抽出する。
その後、このモデルはCHB-MIT Scalp EEG Databaseで微調整され、24人の小児患者の664の脳波記録からなり、そのうち198は発作イベントを含んでいる。
主な貢献はCHB-MITデータセットの微調整の最適化であり、モデルアーキテクチャ、前処理、後処理技術の影響を徹底的に調べ、感度を高め、1時間あたりの偽陽性を減らす(FP/h)。
また、最も効果的なセットアップを確認するために、カスタムトレーニング戦略についても検討しました。
このモデルは、被験者固有の微調整の前に、新しい第2の事前訓練フェーズを実行し、その一般化能力を高めた。
最適化されたモデルでは、ベースラインモデルよりも0.23 FP/h、2.5$\times$低い性能向上を実現し、低いが許容できる感度率で、EEGベースの発作検出にBERTベースのアプローチを適用する効果を示す。
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