論文の概要: Anatomical Foundation Models for Brain MRIs
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2408.07079v2
- Date: Tue, 5 Nov 2024 19:44:03 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-11-08 11:26:46.560974
- Title: Anatomical Foundation Models for Brain MRIs
- Title(参考訳): 脳MRIの解剖基盤モデル
- Authors: Carlo Alberto Barbano, Matteo Brunello, Benoit Dufumier, Marco Grangetto,
- Abstract要約: AnatCLは、弱い対照的な学習アプローチで解剖情報を活用する脳MRIのための解剖基盤モデルである。
アプローチを検証するために,診断分類のための12の下流タスクと10の異なる臨床評価スコアの予測について検討した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.993491018326816
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Deep Learning (DL) in neuroimaging has become increasingly relevant for detecting neurological conditions and neurodegenerative disorders. One of the most predominant biomarkers in neuroimaging is represented by brain age, which has been shown to be a good indicator for different conditions, such as Alzheimer's Disease. Using brain age for pretraining DL models in transfer learning settings has also recently shown promising results, especially when dealing with data scarcity of different conditions. On the other hand, anatomical information of brain MRIs (e.g. cortical thickness) can provide important information for learning good representations that can be transferred to many downstream tasks. In this work, we propose AnatCL, an anatomical foundation model for brain MRIs that i.) leverages anatomical information with a weakly contrastive learning approach and ii.) achieves state-of-the-art performances in many different downstream tasks. To validate our approach we consider 12 different downstream tasks for diagnosis classification, and prediction of 10 different clinical assessment scores. Pretrained models can be found at https://github.com/EIDOSLAB/AnatCL.
- Abstract(参考訳): 神経画像における深層学習(DL)は、神経疾患や神経変性疾患の検出においてますます重要になっている。
神経イメージングにおける最も主要なバイオマーカーの1つは、アルツハイマー病など様々な疾患の指標である脳年齢である。
転送学習設定におけるDLモデルの事前学習に脳年齢を用いると、特に異なる条件のデータ不足に対処する場合に有望な結果が示されている。
一方、脳MRIの解剖学的情報(例えば皮質の厚さ)は、多くの下流タスクに転送できる優れた表現を学習するための重要な情報を提供することができる。
本研究では,脳MRIの解剖学的基礎モデルであるAnatCLを提案する。
) 解剖学的情報を弱対照的な学習アプローチとiiで活用する。
は、多くのダウンストリームタスクで最先端のパフォーマンスを達成する。
アプローチを検証するために,診断分類のための12の下流タスクと10の異なる臨床評価スコアの予測について検討した。
事前訓練されたモデルはhttps://github.com/EIDOSLAB/AnatCLで見ることができる。
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