論文の概要: Intraoperative Glioma Segmentation with YOLO + SAM for Improved Accuracy in Tumor Resection
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2408.14847v1
- Date: Tue, 27 Aug 2024 07:58:08 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-08-28 14:33:22.625648
- Title: Intraoperative Glioma Segmentation with YOLO + SAM for Improved Accuracy in Tumor Resection
- Title(参考訳): 腫瘍切除の精度向上を目的としたYOLO+SAMを用いた術中グリオーマ分画術
- Authors: Samir Kassam, Angelo Markham, Katie Vo, Yashas Revanakara, Michael Lam, Kevin Zhu,
- Abstract要約: グリオーマは、健康な組織との類似性から、重要な外科的課題を呈する。
MRI画像は、脳のシフトなどの要因により、手術中は効果がないことが多い。
本稿では,You Only Look Once Version 8 (Yv8) と Segment Anything Model Vision Transformer-base を組み合わせたディープラーニングパイプラインを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.9461727843485295
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Gliomas, a common type of malignant brain tumor, present significant surgical challenges due to their similarity to healthy tissue. Preoperative Magnetic Resonance Imaging (MRI) images are often ineffective during surgery due to factors such as brain shift, which alters the position of brain structures and tumors. This makes real-time intraoperative MRI (ioMRI) crucial, as it provides updated imaging that accounts for these shifts, ensuring more accurate tumor localization and safer resections. This paper presents a deep learning pipeline combining You Only Look Once Version 8 (YOLOv8) and Segment Anything Model Vision Transformer-base (SAM ViT-b) to enhance glioma detection and segmentation during ioMRI. Our model was trained using the Brain Tumor Segmentation 2021 (BraTS 2021) dataset, which includes standard magnetic resonance imaging (MRI) images, and noise-augmented MRI images that simulate ioMRI images. Noised MRI images are harder for a deep learning pipeline to segment, but they are more representative of surgical conditions. Achieving a Dice Similarity Coefficient (DICE) score of 0.79, our model performs comparably to state-of-the-art segmentation models tested on noiseless data. This performance demonstrates the model's potential to assist surgeons in maximizing tumor resection and improving surgical outcomes.
- Abstract(参考訳): 悪性脳腫瘍の一種であるグリオーマは、健康な組織との類似性から、重要な外科的課題を呈している。
術前磁気共鳴イメージング(MRI)画像は、脳構造や腫瘍の位置を変える脳のシフトなどの要因により、手術中は効果がないことが多い。
これにより、リアルタイムの術中MRI(ioMRI)が重要となり、これらの変化を反映した画像が更新され、より正確な腫瘍の局所化とより安全な切除が保証される。
本稿では,OoMRIにおけるグリオーマ検出とセグメンテーションを強化するために,You Only Look Once Version 8 (YOLOv8) と Segment Anything Model Vision Transformer-base (SAM ViT-b) を組み合わせたディープラーニングパイプラインを提案する。
脳腫瘍分離2021(BraTS 2021)データセットを用いて、標準磁気共鳴画像(MRI)画像と、ioMRI像をシミュレートしたノイズ強調MRI画像を含む訓練を行った。
ノイズMRI画像は、深層学習パイプラインのセグメント化が難しいが、より手術条件を代表している。
Dice similarity Coefficient(DICE)スコア0.79を達成し、ノイズのないデータでテストされた最先端のセグメンテーションモデルと相容れない性能を実現した。
この性能は、腫瘍切除の最大化と手術成績の改善において、外科医を支援するモデルの可能性を示している。
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