論文の概要: Technical Report of HelixFold3 for Biomolecular Structure Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2408.16975v2
- Date: Mon, 9 Sep 2024 02:44:49 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-09-10 23:12:22.467498
- Title: Technical Report of HelixFold3 for Biomolecular Structure Prediction
- Title(参考訳): HelixFold3による生体分子構造予測技術
- Authors: Lihang Liu, Shanzhuo Zhang, Yang Xue, Xianbin Ye, Kunrui Zhu, Yuxin Li, Yang Liu, Wenlai Zhao, Hongkun Yu, Zhihua Wu, Xiaonan Zhang, Xiaomin Fang,
- Abstract要約: AlphaFoldはタンパク質構造予測を顕著な精度で変換した。
HelixFold3はAlphaFold3の機能の複製を目指している。
HelixFold3の初期リリースはGitHubでオープンソースとして公開されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 12.848589926054565
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: The AlphaFold series has transformed protein structure prediction with remarkable accuracy, often matching experimental methods. AlphaFold2, AlphaFold-Multimer, and the latest AlphaFold3 represent significant strides in predicting single protein chains, protein complexes, and biomolecular structures. While AlphaFold2 and AlphaFold-Multimer are open-sourced, facilitating rapid and reliable predictions, AlphaFold3 remains partially accessible through a limited online server and has not been open-sourced, restricting further development. To address these challenges, the PaddleHelix team is developing HelixFold3, aiming to replicate AlphaFold3's capabilities. Using insights from previous models and extensive datasets, HelixFold3 achieves an accuracy comparable to AlphaFold3 in predicting the structures of conventional ligands, nucleic acids, and proteins. The initial release of HelixFold3 is available as open source on GitHub for academic research, promising to advance biomolecular research and accelerate discoveries. We also provide online service at PaddleHelix website at https://paddlehelix.baidu.com/app/all/helixfold3/forecast.
- Abstract(参考訳): AlphaFoldシリーズはタンパク質構造予測を顕著な精度で変換し、しばしば実験手法と一致する。
AlphaFold2、AlphaFold-Multimer、そして最新のAlphaFold3は、単一のタンパク質鎖、タンパク質複合体、生体分子構造を予測する重要なステップである。
AlphaFold2とAlphaFold-Multimerはオープンソースであり、迅速で信頼性の高い予測を促進する。
これらの課題に対処するため、PaddleHelixチームは、AlphaFold3の機能の再現を目的としたHelixFold3を開発している。
HelixFold3は、以前のモデルと広範なデータセットからの洞察を用いて、従来のリガンド、核酸、タンパク質の構造を予測するためにAlphaFold3に匹敵する精度を達成する。
HelixFold3の最初のリリースは、学術研究のためのGitHub上のオープンソースとして利用可能であり、生体分子研究の進歩と発見の加速を約束している。
また、PaddleHelixのウェブサイトでhttps://paddlehelix.baidu.com/app/all/helixfold3/forecast.comでオンラインサービスを提供しています。
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