論文の概要: Improving Uncertainty-Error Correspondence in Deep Bayesian Medical Image Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2409.03470v1
- Date: Thu, 5 Sep 2024 12:31:51 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-09-06 20:50:03.313686
- Title: Improving Uncertainty-Error Correspondence in Deep Bayesian Medical Image Segmentation
- Title(参考訳): 深部ベイズ医用画像分割における不確かさと誤りの対応性の改善
- Authors: Prerak Mody, Nicolas F. Chaves-de-Plaza, Chinmay Rao, Eleftheria Astrenidou, Mischa de Ridder, Nienke Hoekstra, Klaus Hildebrandt, Marius Staring,
- Abstract要約: 不正確な領域のみに存在する不確実性を促進するために、FlipOutモデルに精度-vs-不確実性(AvU)損失を学習する。
本手法を頭頸部CTと前立腺MRIの2つの放射線治療部位のデータセットに適用する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.3572047447192626
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Increased usage of automated tools like deep learning in medical image segmentation has alleviated the bottleneck of manual contouring. This has shifted manual labour to quality assessment (QA) of automated contours which involves detecting errors and correcting them. A potential solution to semi-automated QA is to use deep Bayesian uncertainty to recommend potentially erroneous regions, thus reducing time spent on error detection. Previous work has investigated the correspondence between uncertainty and error, however, no work has been done on improving the "utility" of Bayesian uncertainty maps such that it is only present in inaccurate regions and not in the accurate ones. Our work trains the FlipOut model with the Accuracy-vs-Uncertainty (AvU) loss which promotes uncertainty to be present only in inaccurate regions. We apply this method on datasets of two radiotherapy body sites, c.f. head-and-neck CT and prostate MR scans. Uncertainty heatmaps (i.e. predictive entropy) are evaluated against voxel inaccuracies using Receiver Operating Characteristic (ROC) and Precision-Recall (PR) curves. Numerical results show that when compared to the Bayesian baseline the proposed method successfully suppresses uncertainty for accurate voxels, with similar presence of uncertainty for inaccurate voxels. Code to reproduce experiments is available at https://github.com/prerakmody/bayesuncertainty-error-correspondence
- Abstract(参考訳): 医用画像のセグメンテーションにおけるディープラーニングのような自動化ツールの使用の増加は、手動コントゥーリングのボトルネックを軽減する。
これは手作業から,エラーの検出と修正を含む自動輪郭の品質評価(QA)へと移行した。
半自動QAの潜在的な解決策は、深いベイズの不確実性を使用して、潜在的に誤った領域を推奨し、エラー検出に費やした時間を短縮することである。
従来,不確かさと誤りの対応について検討されてきたが,ベイズの不確実性マップの「有効性」を改善するための研究は行われていない。
我々の研究は、不正確な領域にのみ存在する不確実性を促進する精度-vs-不確実性(AvU)損失でFlipOutモデルを訓練する。
本手法を頭頸部CTと前立腺MRIの2つの放射線治療部位のデータセットに適用する。
不確実性熱マップ(すなわち予測エントロピー)は、受信器動作特性(ROC)と高精度リコール(PR)曲線を用いてボクセル不正確な値に対して評価される。
数値計算により,ベイズ基底線と比較した場合,提案手法は精度の高いボクセルの不確かさを抑えることができた。
実験を再現するコードはhttps://github.com/prerakmody/bayesuncertainty-error-corssociatedenceで公開されている。
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