論文の概要: Exploiting XAI maps to improve MS lesion segmentation and detection in MRI
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2409.03772v1
- Date: Wed, 21 Aug 2024 07:49:01 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-09-15 05:41:23.410698
- Title: Exploiting XAI maps to improve MS lesion segmentation and detection in MRI
- Title(参考訳): MRIにおけるXAIマップによるMS病変のセグメンテーションと検出の改善
- Authors: Federico Spagnolo, Nataliia Molchanova, Mario Ocampo Pineda, Lester Melie-Garcia, Meritxell Bach Cuadra, Cristina Granziera, Vincent Andrearczyk, Adrien Depeursinge,
- Abstract要約: 本研究は, 病変特異的唾液度マップの特性を利用して, セグメンテーションと検出スコアを洗練させる方法について検討する。
第1組の地図から抽出した93個の放射能特性をロジスティック回帰モデルの訓練に用いた。
テストセットでは,初期モデルと比較してF1スコアとPPVが大きなマージンで改善された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.024819169163989
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: To date, several methods have been developed to explain deep learning algorithms for classification tasks. Recently, an adaptation of two of such methods has been proposed to generate instance-level explainable maps in a semantic segmentation scenario, such as multiple sclerosis (MS) lesion segmentation. In the mentioned work, a 3D U-Net was trained and tested for MS lesion segmentation, yielding an F1 score of 0.7006, and a positive predictive value (PPV) of 0.6265. The distribution of values in explainable maps exposed some differences between maps of true and false positive (TP/FP) examples. Inspired by those results, we explore in this paper the use of characteristics of lesion-specific saliency maps to refine segmentation and detection scores. We generate around 21000 maps from as many TP/FP lesions in a batch of 72 patients (training set) and 4868 from the 37 patients in the test set. 93 radiomic features extracted from the first set of maps were used to train a logistic regression model and classify TP versus FP. On the test set, F1 score and PPV were improved by a large margin when compared to the initial model, reaching 0.7450 and 0.7817, with 95% confidence intervals of [0.7358, 0.7547] and [0.7679, 0.7962], respectively. These results suggest that saliency maps can be used to refine prediction scores, boosting a model's performances.
- Abstract(参考訳): これまで,分類タスクの深層学習アルゴリズムを説明するために,いくつかの手法が開発されてきた。
近年, 多発性硬化症 (MS) 病変のセグメンテーションなどの意味的セグメンテーションシナリオにおいて, インスタンスレベルの説明可能なマップを生成するための2つの手法の適応が提案されている。
以上の研究で、3D U-Netをトレーニングし、MS病変のセグメンテーションの試験を行い、F1スコアは0.7006、PPVは0.6265とした。
説明可能な写像における値の分布は、真と偽陽性(TP/FP)の例のいくつかの違いを露呈した。
これらの結果から着想を得た本論文では,病変特異的な塩分濃度マップの特性を利用してセグメンテーションと検出スコアを洗練させる方法について検討する。
72例(トレーニングセット)のTP/FP病変から約21000点,検査セット中の37例から4868点の地図を作成した。
第1組の地図から抽出した93個の放射能特性を用いて,ロジスティック回帰モデルを訓練し,TPとFPの分類を行った。
テストセットでは, F1スコアとPPVは, 初期モデルと比較して, 0.7450, 0.7817, 95%信頼区間 [0.7358, 0.7547] と [0.7679, 0.7962] で大きく改善した。
これらの結果から, 精度マップを用いて予測スコアを改良し, モデルの性能を向上させることが示唆された。
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