論文の概要: Uncovering the Mechanism of Hepatotoxiciy of PFAS Targeting L-FABP Using GCN and Computational Modeling
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2409.10370v1
- Date: Mon, 16 Sep 2024 15:13:39 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-09-17 15:00:57.298862
- Title: Uncovering the Mechanism of Hepatotoxiciy of PFAS Targeting L-FABP Using GCN and Computational Modeling
- Title(参考訳): GCNと計算モデルを用いたPFASターゲットL-FABPの肝毒性機構の解明
- Authors: Lucas Jividen, Tibo Duran, Xi-Zhi Niu, Jun Bai,
- Abstract要約: ペルフルオロアルキル(PFAS)とポリフルオロアルキル(PFAS)は環境汚染物質であり、毒性や生物蓄積に問題がある。
本研究では, 半教師付きグラフ畳み込みネットワーク(GCN)と分子ディスクリプタと指紋を組み合わせることにより, PFAS毒性の予測モデルを作成する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.6249398255272316
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS) are persistent environmental pollutants with known toxicity and bioaccumulation issues. Their widespread industrial use and resistance to degradation have led to global environmental contamination and significant health concerns. While a minority of PFAS have been extensively studied, the toxicity of many PFAS remains poorly understood due to limited direct toxicological data. This study advances the predictive modeling of PFAS toxicity by combining semi-supervised graph convolutional networks (GCNs) with molecular descriptors and fingerprints. We propose a novel approach to enhance the prediction of PFAS binding affinities by isolating molecular fingerprints to construct graphs where then descriptors are set as the node features. This approach specifically captures the structural, physicochemical, and topological features of PFAS without overfitting due to an abundance of features. Unsupervised clustering then identifies representative compounds for detailed binding studies. Our results provide a more accurate ability to estimate PFAS hepatotoxicity to provide guidance in chemical discovery of new PFAS and the development of new safety regulations.
- Abstract(参考訳): ペルフルオロアルキル(PFAS)とポリフルオロアルキル(PFAS)は環境汚染物質であり、毒性や生物蓄積に問題がある。
産業利用の拡大と劣化に対する抵抗により、地球規模の環境汚染と深刻な健康上の懸念がもたらされた。
PFASのマイノリティは広く研究されているが、直接毒性データが少ないため、多くのPFASの毒性はよく分かっていない。
本研究では, 半教師付きグラフ畳み込みネットワーク(GCN)と分子ディスクリプタと指紋を組み合わせることにより, PFAS毒性の予測モデルを作成する。
本稿では,PFAS結合親和性の予測に分子指紋を分離してグラフを構築する手法を提案する。
このアプローチは、PFASの構造、物理化学的、およびトポロジカルな特徴を、多量の特徴により過度に適合させることなく、明確に捉えている。
教師なしクラスタリングは、詳細な結合研究のための代表化合物を同定する。
以上の結果から,PFASの肝毒性を推定し,新しいPFASの化学的発見と新しい安全基準の策定の指針を提供することができた。
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