論文の概要: Enhanced segmentation of femoral bone metastasis in CT scans of patients using synthetic data generation with 3D diffusion models
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2409.11011v1
- Date: Tue, 17 Sep 2024 09:21:19 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-09-18 17:18:54.066969
- Title: Enhanced segmentation of femoral bone metastasis in CT scans of patients using synthetic data generation with 3D diffusion models
- Title(参考訳): 3次元拡散モデルを用いた人工骨を用いたCTスキャンにおける大腿骨骨転移のセグメンテーション
- Authors: Emile Saillard, Aurélie Levillain, David Mitton, Jean-Baptiste Pialat, Cyrille Confavreux, Hélène Follet, Thomas Grenier,
- Abstract要約: 本稿では,3次元拡散確率モデル(DDPM)を用いた自動データパイプラインを提案する。
5675巻を新たに作成し,実データと合成データに基づいて3次元U-Netセグメンテーションモデルを訓練し,セグメンテーション性能を比較した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.06700983301090582
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Purpose: Bone metastasis have a major impact on the quality of life of patients and they are diverse in terms of size and location, making their segmentation complex. Manual segmentation is time-consuming, and expert segmentations are subject to operator variability, which makes obtaining accurate and reproducible segmentations of bone metastasis on CT-scans a challenging yet important task to achieve. Materials and Methods: Deep learning methods tackle segmentation tasks efficiently but require large datasets along with expert manual segmentations to generalize on new images. We propose an automated data synthesis pipeline using 3D Denoising Diffusion Probabilistic Models (DDPM) to enchance the segmentation of femoral metastasis from CT-scan volumes of patients. We used 29 existing lesions along with 26 healthy femurs to create new realistic synthetic metastatic images, and trained a DDPM to improve the diversity and realism of the simulated volumes. We also investigated the operator variability on manual segmentation. Results: We created 5675 new volumes, then trained 3D U-Net segmentation models on real and synthetic data to compare segmentation performance, and we evaluated the performance of the models depending on the amount of synthetic data used in training. Conclusion: Our results showed that segmentation models trained with synthetic data outperformed those trained on real volumes only, and that those models perform especially well when considering operator variability.
- Abstract(参考訳): 目的: 骨転移は患者の生活の質に大きな影響を与え, サイズや位置の面では多様であり, セグメンテーションは複雑である。
手技の分節は時間を要するため、専門家の分節は操作者の多様性に左右されるため、CTスキャン上の骨転移の正確かつ再現可能な分節を得るのが困難な作業である。
材料と方法: ディープラーニング手法はセグメント化タスクを効率的に処理するが、新しいイメージを一般化するためには、専門的な手動セグメンテーションとともに大きなデータセットを必要とする。
本稿では,3D Denoising Diffusion Probabilistic Models (DDPM) を用いた自動データ合成パイプラインを提案する。
われわれは29の既存の病変と26の健康な大腿骨を用いて新しいリアルな合成転移画像を作成し,シミュレーションボリュームの多様性とリアリズムを改善するためにDDPMを訓練した。
また,手動セグメンテーションにおける操作者の変動について検討した。
結果: 5675新巻を作成した後, 実データと合成データを用いた3次元U-Netセグメンテーションモデルを用いて, セグメンテーション性能を比較した。
結論: 実験結果から, 合成データを用いたセグメンテーションモデルの方が実数量のみのセグメンテーションモデルよりも優れており, 操作者の変動を考慮した場合, 特に良好に機能することがわかった。
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