論文の概要: EFCM: Efficient Fine-tuning on Compressed Models for deployment of large models in medical image analysis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2409.11817v1
- Date: Wed, 18 Sep 2024 09:08:16 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-09-19 18:34:01.695042
- Title: EFCM: Efficient Fine-tuning on Compressed Models for deployment of large models in medical image analysis
- Title(参考訳): EFCM: 医用画像解析における大規模モデルの展開のための圧縮モデルの効率的な微調整
- Authors: Shaojie Li, Zhaoshuo Diao,
- Abstract要約: 本研究では,非監督的特徴蒸留と微調整の2段階からなる圧縮モデル(EFCM)フレームワークの効率的な微調整について述べる。
実験は、網膜用RETFound、胸部X線用MRM、病理組織学用BROWの3つの大きな医療モデルに関連する11の下流データセットで実施された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 17.876140405367764
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The recent development of deep learning large models in medicine shows remarkable performance in medical image analysis and diagnosis, but their large number of parameters causes memory and inference latency challenges. Knowledge distillation offers a solution, but the slide-level gradients cannot be backpropagated for student model updates due to high-resolution pathological images and slide-level labels. This study presents an Efficient Fine-tuning on Compressed Models (EFCM) framework with two stages: unsupervised feature distillation and fine-tuning. In the distillation stage, Feature Projection Distillation (FPD) is proposed with a TransScan module for adaptive receptive field adjustment to enhance the knowledge absorption capability of the student model. In the slide-level fine-tuning stage, three strategies (Reuse CLAM, Retrain CLAM, and End2end Train CLAM (ETC)) are compared. Experiments are conducted on 11 downstream datasets related to three large medical models: RETFound for retina, MRM for chest X-ray, and BROW for histopathology. The experimental results demonstrate that the EFCM framework significantly improves accuracy and efficiency in handling slide-level pathological image problems, effectively addressing the challenges of deploying large medical models. Specifically, it achieves a 4.33% increase in ACC and a 5.2% increase in AUC compared to the large model BROW on the TCGA-NSCLC and TCGA-BRCA datasets. The analysis of model inference efficiency highlights the high efficiency of the distillation fine-tuning method.
- Abstract(参考訳): 近年の医学における深層学習大型モデルの開発は, 画像解析や診断において顕著な性能を示したが, 多数のパラメータが記憶と推論遅延の課題を引き起こしている。
知識蒸留は解法を提供するが、高解像度の病理画像とスライドレベルのラベルのために、学生モデルの更新のためにスライドレベルの勾配を逆転することはできない。
本研究では,非監督的特徴蒸留と微調整の2段階からなる圧縮モデル(EFCM)フレームワークの効率的な微調整について述べる。
蒸留段階では, 学生モデルの知識吸収能力を高めるために, 適応的受容場調整のためのTransScanモジュールを用いて, FPD (Feature Projection Distillation) を提案する。
スライドレベルの微調整では、3つの戦略(リユースCLAM、リユースCLAM、エンド2エンドトレインCLAM(ETC))を比較した。
実験は、網膜用RETFound、胸部X線用MRM、病理組織学用BROWの3つの大きな医療モデルに関連する11の下流データセットで実施された。
実験の結果,EFCMフレームワークはスライドレベルの画像問題に対処する際の精度と効率を著しく向上し,大規模医療モデルを展開する上での課題に効果的に対処できることが示唆された。
具体的には、TGA-NSCLCとTGA-BRCAデータセットの大規模モデルBROWと比較してACCが4.33%増加し、AUCが5.2%増加した。
モデル推論効率の解析は蒸留微調整法の高効率性を強調する。
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