論文の概要: Understanding Stain Separation Improves Cross-Scanner Adenocarcinoma Segmentation with Joint Multi-Task Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2409.13246v1
- Date: Fri, 20 Sep 2024 06:12:52 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-11-07 11:18:04.191597
- Title: Understanding Stain Separation Improves Cross-Scanner Adenocarcinoma Segmentation with Joint Multi-Task Learning
- Title(参考訳): マルチタスク学習によるクロススキャナ腺癌分画の改善
- Authors: Ho Heon Kim, Won Chan Jeong, Young Shin Ko, Young Jin Park,
- Abstract要約: デジタル病理学は腫瘍の診断とセグメンテーションに大きな進歩をもたらしたが、画像の可変性は現在のアルゴリズムの有効性を制限している。
COSAS (Cross-Organ and Cross-Scanner Adenocarcinoma) は、セグメント化アルゴリズムのドメインシフトに対するレジリエンスを改善することでこの問題に対処している。
提案手法では,マルチデコーダオートエンコーダを用いたマルチタスク学習フレームワーク内での汚れ分離による教師なし学習を採用する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.3470559413988936
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Digital pathology has made significant advances in tumor diagnosis and segmentation, but image variability due to differences in organs, tissue preparation, and acquisition - known as domain shift - limits the effectiveness of current algorithms. The COSAS (Cross-Organ and Cross-Scanner Adenocarcinoma Segmentation) challenge addresses this issue by improving the resilience of segmentation algorithms to domain shift, with Task 2 focusing on adenocarcinoma segmentation using a diverse dataset from six scanners, pushing the boundaries of clinical diagnostics. Our approach employs unsupervised learning through stain separation within a multi-task learning framework using a multi-decoder autoencoder. This model isolates stain matrix and stain density, allowing it to handle color variation and improve generalization across scanners. We further enhanced the robustness of the model with a mixture of stain augmentation techniques and used a U-net architecture for segmentation. The novelty of our method lies in the use of stain separation within a multi-task learning framework, which effectively disentangles histological structures from color variations. This approach shows promise for improving segmentation accuracy and generalization across different histopathological stains, paving the way for more reliable diagnostic tools in digital pathology.
- Abstract(参考訳): デジタル病理学は、腫瘍の診断とセグメンテーションに大きな進歩をもたらしたが、臓器、組織の準備、取得(ドメインシフトとして知られる)の違いによる画像の多様性は、現在のアルゴリズムの有効性を制限している。
COSAS(Cross-Organ and Cross-Scanner Adenocarcinoma Segmentation)は、セグメンテーションアルゴリズムのドメインシフトに対するレジリエンスを改善することでこの問題に対処する。
提案手法では,マルチデコーダオートエンコーダを用いたマルチタスク学習フレームワーク内での汚れ分離による教師なし学習を採用する。
このモデルは、染色マトリクスと染色密度を分離し、色の変化を処理し、スキャナー間の一般化を改善する。
さらに,ステン強化技術の混合によりモデルの堅牢性を高め,セグメンテーションにU-netアーキテクチャを使用した。
本手法の新規性はマルチタスク学習フレームワーク内での染色分離の利用であり,色の変化から組織構造を効果的に切り離すことができる。
このアプローチは、異なる病理組織染色のセグメンテーション精度と一般化を改善し、デジタル病理学におけるより信頼性の高い診断ツールの道を開くことを約束する。
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