論文の概要: Multi-Modality Conditioned Variational U-Net for Field-of-View Extension in Brain Diffusion MRI
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2409.13846v1
- Date: Fri, 20 Sep 2024 18:41:29 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-11-07 05:01:49.601207
- Title: Multi-Modality Conditioned Variational U-Net for Field-of-View Extension in Brain Diffusion MRI
- Title(参考訳): 脳拡散MRIにおける視野拡大のための多モード条件変分U-Net
- Authors: Zhiyuan Li, Tianyuan Yao, Praitayini Kanakaraj, Chenyu Gao, Shunxing Bao, Lianrui Zuo, Michael E. Kim, Nancy R. Newlin, Gaurav Rudravaram, Nazirah M. Khairi, Yuankai Huo, Kurt G. Schilling, Walter A. Kukull, Arthur W. Toga, Derek B. Archer, Timothy J. Hohman, Bennett A. Landman,
- Abstract要約: 拡散磁気共鳴イメージング(dMRI)における不完全視野(FOV)は、全脳白質結合の体積および束解析を著しく阻害することができる。
FOVの取得部位における学習拡散特徴を脳解剖学的構造に組み込むことにより, FOVの不完全部分におけるdMRIスキャンを計算するための新しい枠組みを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 10.096809077954095
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: An incomplete field-of-view (FOV) in diffusion magnetic resonance imaging (dMRI) can severely hinder the volumetric and bundle analyses of whole-brain white matter connectivity. Although existing works have investigated imputing the missing regions using deep generative models, it remains unclear how to specifically utilize additional information from paired multi-modality data and whether this can enhance the imputation quality and be useful for downstream tractography. To fill this gap, we propose a novel framework for imputing dMRI scans in the incomplete part of the FOV by integrating the learned diffusion features in the acquired part of the FOV to the complete brain anatomical structure. We hypothesize that by this design the proposed framework can enhance the imputation performance of the dMRI scans and therefore be useful for repairing whole-brain tractography in corrupted dMRI scans with incomplete FOV. We tested our framework on two cohorts from different sites with a total of 96 subjects and compared it with a baseline imputation method that treats the information from T1w and dMRI scans equally. The proposed framework achieved significant improvements in imputation performance, as demonstrated by angular correlation coefficient (p < 1E-5), and in downstream tractography accuracy, as demonstrated by Dice score (p < 0.01). Results suggest that the proposed framework improved imputation performance in dMRI scans by specifically utilizing additional information from paired multi-modality data, compared with the baseline method. The imputation achieved by the proposed framework enhances whole brain tractography, and therefore reduces the uncertainty when analyzing bundles associated with neurodegenerative.
- Abstract(参考訳): 拡散磁気共鳴イメージング(dMRI)における不完全視野(FOV)は、全脳白質結合の体積および束解析を著しく阻害することができる。
既存の研究は, 深部生成モデルを用いて, 欠落した領域をインパルス化することを検討したが, ペア化された多モードデータから追加情報をどのように活用するか, そして, インパルス化の質を高め, 下流のトラクトグラフィーに有用かは定かではない。
このギャップを埋めるために、FOVの取得した部分における学習拡散特徴を完全な脳解剖学的構造に統合することにより、FOVの不完全部分におけるdMRIスキャンを計算するための新しい枠組みを提案する。
この設計により,提案するフレームワークは,dMRIスキャンの計算性能を向上し,不完全なFOVによる破壊dMRIスキャンにおける全脳トラクトグラフィーの修復に有用である,という仮説を立てる。
96名の被験者の異なる2つのコホートでフレームワークを試験し、T1wとdMRIの情報を等しく扱うベースライン計算法と比較した。
提案手法は,角相関係数 (p < 1E-5) で示されるような計算性能と,Dice スコア (p < 0.01) で示される下流トラクトグラフィーの精度において有意に向上した。
提案手法は, ベースライン法と比較して, 対の多重モードデータから追加情報を活用することにより, dMRIスキャンのインパルス化性能を向上させることが示唆された。
提案手法によって達成されたインプットは、全脳トラクトグラフィーを増強し、神経変性に関連する束を分析する際の不確実性を低下させる。
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