論文の概要: Assumption-Lean Post-Integrated Inference with Negative Control Outcomes
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2410.04996v2
- Date: Sun, 24 Nov 2024 19:08:47 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-11-26 14:16:17.709723
- Title: Assumption-Lean Post-Integrated Inference with Negative Control Outcomes
- Title(参考訳): 負の制御結果を持つ推定-負の独立後推論
- Authors: Jin-Hong Du, Kathryn Roeder, Larry Wasserman,
- Abstract要約: 負の制御結果を用いて遅延不均一性を調整する頑健なポストインテグレート推論(PII)手法を提案する。
提案手法は,予測された直接効果推定値,隠された仲介者,共同設立者,モデレーターまで拡張する。
提案された二重頑健な推定器は、最小の仮定と潜在的な不特定性の下で一貫性があり、効率的である。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License:
- Abstract: Data integration methods aim to extract low-dimensional embeddings from high-dimensional outcomes to remove unwanted variations, such as batch effects and unmeasured covariates, across heterogeneous datasets. However, multiple hypothesis testing after integration can be biased due to data-dependent processes. We introduce a robust post-integrated inference (PII) method that adjusts for latent heterogeneity using negative control outcomes. Leveraging causal interpretations, we derive nonparametric identifiability of the direct effects, which motivates our semiparametric inference method. Our method extends to projected direct effect estimands, accounting for hidden mediators, confounders, and moderators. These estimands remain statistically meaningful under model misspecifications and with error-prone embeddings. We provide bias quantifications and finite-sample linear expansions with uniform concentration bounds. The proposed doubly robust estimators are consistent and efficient under minimal assumptions and potential misspecification, facilitating data-adaptive estimation with machine learning algorithms. Our proposal is evaluated with random forests through simulations and analysis of single-cell CRISPR perturbed datasets with potential unmeasured confounders.
- Abstract(参考訳): データ統合手法は、高次元結果から低次元埋め込みを抽出し、不均一なデータセット間でバッチ効果や非測定共変量などの不要な変動を取り除くことを目的としている。
しかし、統合後の複数の仮説テストは、データ依存プロセスによってバイアスを受けることができる。
負の制御結果を用いて遅延不均一性を調整する頑健なポストインテグレート推論(PII)手法を提案する。
因果解釈を活用することで、直接効果の非パラメトリック識別性を導き出し、これが我々の半パラメトリック推論法を動機づける。
提案手法は,予測された直接効果推定値,隠された仲介者,共同設立者,モデレーターまで拡張する。
これらの推定値は、モデルミススペクテーションやエラーを起こしやすい埋め込みの下で統計的に有意なままである。
我々は、一様濃度境界を持つバイアス量子化と有限サンプル線形展開を提供する。
提案した二重頑健な推定器は、最小限の仮定と潜在的な誤特定の下で一貫性があり、機械学習アルゴリズムによるデータ適応推定を容易にする。
提案手法は単セルCRISPR摂動データセットのシミュレーションと解析によりランダム森林を用いて評価する。
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