論文の概要: Leveraging Social Determinants of Health in Alzheimer's Research Using LLM-Augmented Literature Mining and Knowledge Graphs
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2410.09080v1
- Date: Fri, 4 Oct 2024 21:39:30 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-10-30 16:48:15.054894
- Title: Leveraging Social Determinants of Health in Alzheimer's Research Using LLM-Augmented Literature Mining and Knowledge Graphs
- Title(参考訳): LLM増補文学マイニングと知識グラフを用いたアルツハイマー研究における社会的健康要因の活用
- Authors: Tianqi Shang, Shu Yang, Weiqing He, Tianhua Zhai, Dawei Li, Bojian Hou, Tianlong Chen, Jason H. Moore, Marylyn D. Ritchie, Li Shen,
- Abstract要約: 成長する証拠は、社会的健康決定因子(SDoH)がアルツハイマー病(AD)と関連する認知症を発症する個人のリスクに影響を与えることを示唆している。
本研究は、SDoHの知識を広範囲にわたる文献から抽出し、AD関連生物学的実体と統合するための、新しい自動化された枠組みを提案する。
本フレームワークは,ADにおける知識発見の促進を約束し,他のSDoH関連研究領域に一般化することができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 33.755845172595365
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Growing evidence suggests that social determinants of health (SDoH), a set of nonmedical factors, affect individuals' risks of developing Alzheimer's disease (AD) and related dementias. Nevertheless, the etiological mechanisms underlying such relationships remain largely unclear, mainly due to difficulties in collecting relevant information. This study presents a novel, automated framework that leverages recent advancements of large language model (LLM) and natural language processing techniques to mine SDoH knowledge from extensive literature and integrate it with AD-related biological entities extracted from the general-purpose knowledge graph PrimeKG. Utilizing graph neural networks, we performed link prediction tasks to evaluate the resultant SDoH-augmented knowledge graph. Our framework shows promise for enhancing knowledge discovery in AD and can be generalized to other SDoH-related research areas, offering a new tool for exploring the impact of social determinants on health outcomes. Our code is available at: https://github.com/hwq0726/SDoHenPKG
- Abstract(参考訳): 成長する証拠は、健康決定因子(SDoH)がアルツハイマー病(AD)と関連する認知症を発症する個人のリスクに影響を与えることを示唆している。
しかしながら、このような関係の根底にある階層的メカニズムは、主に関連情報の収集が困難であるため、ほとんど不明である。
本研究では,大規模言語モデル(LLM)と自然言語処理技術の最近の進歩を活用して,広範な文献からSDoH知識を抽出し,汎用知識グラフ PrimeKG から抽出したAD関連生物学的実体と統合する,新しい自動化フレームワークを提案する。
グラフニューラルネットワークを用いてリンク予測を行い,SDoH強化知識グラフの評価を行った。
本フレームワークは,ADにおける知識発見の促進を約束し,他のSDoH関連研究領域に一般化し,社会要因が健康に与える影響を探索するための新しいツールを提供する。
私たちのコードは、https://github.com/hwq0726/SDoHenPKGで利用可能です。
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