論文の概要: MissNODAG: Differentiable Cyclic Causal Graph Learning from Incomplete Data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2410.18918v1
- Date: Thu, 24 Oct 2024 17:09:10 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-10-25 16:44:20.456199
- Title: MissNODAG: Differentiable Cyclic Causal Graph Learning from Incomplete Data
- Title(参考訳): MissNODAG:不完全データからの微分可能な周期因果グラフ学習
- Authors: Muralikrishnna G. Sethuraman, Razieh Nabi, Faramarz Fekri,
- Abstract要約: 周期因果グラフを学習するためのフレームワークであるMissNODAGを提案する。
提案フレームワークは,付加雑音モデルと予測最大化処理を統合し,出力不足値の交互化と観測データの可能性の最適化を行う。
合成実験によるMissNODAGの有効性と実世界の遺伝子摂動データへの応用を実証する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 13.006241141102
- License:
- Abstract: Causal discovery in real-world systems, such as biological networks, is often complicated by feedback loops and incomplete data. Standard algorithms, which assume acyclic structures or fully observed data, struggle with these challenges. To address this gap, we propose MissNODAG, a differentiable framework for learning both the underlying cyclic causal graph and the missingness mechanism from partially observed data, including data missing not at random. Our framework integrates an additive noise model with an expectation-maximization procedure, alternating between imputing missing values and optimizing the observed data likelihood, to uncover both the cyclic structures and the missingness mechanism. We demonstrate the effectiveness of MissNODAG through synthetic experiments and an application to real-world gene perturbation data.
- Abstract(参考訳): 生物学的ネットワークのような現実世界のシステムにおける因果発見は、フィードバックループや不完全なデータによってしばしば複雑になる。
非循環構造や完全な観測データを想定した標準的なアルゴリズムは、これらの課題に対処する。
このギャップに対処するために、ランダムに欠落しないデータを含む部分的な観測データから、基礎となる巡回因果グラフと欠落メカニズムの両方を学習するための差別化可能なフレームワークであるMissNODAGを提案する。
本フレームワークは, 付加雑音モデルと予測最大化処理を統合し, 提案する欠落値の交互化と観測データの可能性の最適化を行い, 周期構造と欠落機構の両方を明らかにする。
合成実験によるMissNODAGの有効性と実世界の遺伝子摂動データへの応用を実証する。
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