論文の概要: Learning Coupled Subspaces for Multi-Condition Spike Data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2410.19153v1
- Date: Thu, 24 Oct 2024 20:44:28 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-10-28 13:36:15.345637
- Title: Learning Coupled Subspaces for Multi-Condition Spike Data
- Title(参考訳): マルチコンディションスパイクデータのための結合部分空間の学習
- Authors: Yididiya Y. Nadew, Xuhui Fan, Christopher J. Quinn,
- Abstract要約: 神経科学では、研究者は複数の条件下で実験を行い、高次元スパイクトレインデータセットの形で神経応答を得る。
実験条件空間上でスムーズなチューニング関数を学習するための非パラメトリックベイズ手法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.114880112033644
- License:
- Abstract: In neuroscience, researchers typically conduct experiments under multiple conditions to acquire neural responses in the form of high-dimensional spike train datasets. Analysing high-dimensional spike data is a challenging statistical problem. To this end, Gaussian process factor analysis (GPFA), a popular class of latent variable models has been proposed. GPFA extracts smooth, low-dimensional latent trajectories underlying high-dimensional spike train datasets. However, such analyses are often done separately for each experimental condition, contrary to the nature of neural datasets, which contain recordings under multiple experimental conditions. Exploiting the parametric nature of these conditions, we propose a multi-condition GPFA model and inference procedure to learn the underlying latent structure in the corresponding datasets in sample-efficient manner. In particular, we propose a non-parametric Bayesian approach to learn a smooth tuning function over the experiment condition space. Our approach not only boosts model accuracy and is faster, but also improves model interpretability compared to approaches that separately fit models for each experimental condition.
- Abstract(参考訳): 神経科学では、研究者は複数の条件下で実験を行い、高次元スパイクトレインデータセットの形で神経応答を得る。
高次元スパイクデータを解析することは難しい統計問題である。
この目的のために、遅延変数モデルの一般的なクラスであるGaussian Process Factor Analysis (GPFA)が提案されている。
GPFAは、高次元スパイクトレインデータセットに基づく滑らかで低次元の潜在軌道を抽出する。
しかし、これらの分析は、複数の実験条件下での記録を含むニューラルネットワークの性質とは対照的に、実験条件ごとに別々に行われることが多い。
これらの条件のパラメトリックな性質をエクスプロイトし、サンプル効率の良い方法で対応するデータセットの下位の潜伏構造を学習するための多条件GPFAモデルと推論手順を提案する。
特に,実験条件空間上でスムーズなチューニング関数を学習するための非パラメトリックベイズ手法を提案する。
提案手法は, モデル精度を向上し, 高速であるだけでなく, 実験条件ごとに異なるモデルに適合するアプローチに比べて, モデル解釈性も向上する。
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