論文の概要: CurateGPT: A flexible language-model assisted biocuration tool
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2411.00046v1
- Date: Tue, 29 Oct 2024 20:00:04 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-11-05 21:28:22.574431
- Title: CurateGPT: A flexible language-model assisted biocuration tool
- Title(参考訳): CurateGPT:柔軟な言語モデル支援バイオキュレーションツール
- Authors: Harry Caufield, Carlo Kroll, Shawn T O'Neil, Justin T Reese, Marcin P Joachimiak, Harshad Hegde, Nomi L Harris, Madan Krishnamurthy, James A McLaughlin, Damian Smedley, Melissa A Haendel, Peter N Robinson, Christopher J Mungall,
- Abstract要約: ジェネレーティブAIは、人間主導のキュレーションを支援する新しい可能性を開いた。
CurateGPTはキュレーションプロセスの合理化を図り、共同作業と効率性の向上を図っている。
これにより、キュレーター、研究者、エンジニアがキュレーションの取り組みを拡大し、科学データ量の増加に追随するのに役立つ。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.6425885600880427
- License:
- Abstract: Effective data-driven biomedical discovery requires data curation: a time-consuming process of finding, organizing, distilling, integrating, interpreting, annotating, and validating diverse information into a structured form suitable for databases and knowledge bases. Accurate and efficient curation of these digital assets is critical to ensuring that they are FAIR, trustworthy, and sustainable. Unfortunately, expert curators face significant time and resource constraints. The rapid pace of new information being published daily is exceeding their capacity for curation. Generative AI, exemplified by instruction-tuned large language models (LLMs), has opened up new possibilities for assisting human-driven curation. The design philosophy of agents combines the emerging abilities of generative AI with more precise methods. A curator's tasks can be aided by agents for performing reasoning, searching ontologies, and integrating knowledge across external sources, all efforts otherwise requiring extensive manual effort. Our LLM-driven annotation tool, CurateGPT, melds the power of generative AI together with trusted knowledge bases and literature sources. CurateGPT streamlines the curation process, enhancing collaboration and efficiency in common workflows. Compared to direct interaction with an LLM, CurateGPT's agents enable access to information beyond that in the LLM's training data and they provide direct links to the data supporting each claim. This helps curators, researchers, and engineers scale up curation efforts to keep pace with the ever-increasing volume of scientific data.
- Abstract(参考訳): 効果的なデータ駆動バイオメディカルディスカバリは、データキュレーションを必要とする: データベースや知識ベースに適した構造化形式に多様な情報を発見し、整理し、蒸留し、統合し、解釈し、注釈付けし、検証する、時間を要するプロセス。
これらのデジタル資産の正確かつ効率的なキュレーションは、それらがFAIRであり、信頼性があり、持続可能であることを保証するために重要である。
残念ながら、専門家のキュレーターは、かなりの時間とリソースの制約に直面しています。
毎日発行される新しい情報の急速なペースは、キュレーションの能力を超えています。
命令チューニングされた大規模言語モデル(LLM)によって実証されたジェネレーティブAIは、人間主導のキュレーションを支援する新たな可能性を開いた。
エージェントの設計哲学は、生成AIの出現する能力とより正確な方法を組み合わせる。
キュレーターのタスクは、推論、オントロジーの探索、外部ソース間の知識の統合のためのエージェントによって助けられる。
LLMによるアノテーションツールCurateGPTは、信頼できる知識ベースと文献ソースとともに、生成AIのパワーを融合します。
CurateGPTはキュレーションプロセスを合理化し、共通のワークフローにおけるコラボレーションと効率を向上する。
LLMと直接対話するのに対し、CurateGPTのエージェントはLLMのトレーニングデータ以外の情報へのアクセスを可能にし、各クレームをサポートするデータに直接リンクする。
これにより、キュレーター、研究者、エンジニアがキュレーションの取り組みを拡大し、科学データ量の増加に追随するのに役立つ。
関連論文リスト
- Automating Knowledge Discovery from Scientific Literature via LLMs: A Dual-Agent Approach with Progressive Ontology Prompting [59.97247234955861]
LLM-Duoという,プログレッシブプロンプトアルゴリズムとデュアルエージェントシステムを組み合わせた,大規模言語モデル(LLM)に基づく新しいフレームワークを提案する。
言語治療領域における64,177論文からの2,421件の介入を同定した。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-08-20T16:42:23Z) - Human-artificial intelligence teaming for scientific information extraction from data-driven additive manufacturing research using large language models [3.0061386772253784]
近年,データ駆動型アダプティブ・マニュファクチャリング(AM)の研究は大きな成功を収めている。
この結果、多くの科学文献が誕生した。
これらの作品から科学的情報を取り出すにはかなりの労力と時間を要する。
本稿では,AMとAIの専門家が共同で,データ駆動型AM文献から科学情報を継続的に抽出するフレームワークを提案する。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-07-26T15:43:52Z) - AvaTaR: Optimizing LLM Agents for Tool Usage via Contrastive Reasoning [93.96463520716759]
大規模言語モデル(LLM)エージェントは、精度と幻覚を高めるために外部ツールと知識を活用する際、印象的な能力を示した。
本稿では、LLMエージェントを最適化して提供されたツールを効果的に活用し、与えられたタスクのパフォーマンスを向上させる新しい自動化フレームワークであるAvaTaRを紹介する。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-06-17T04:20:02Z) - Self-Tuning: Instructing LLMs to Effectively Acquire New Knowledge through Self-Teaching [67.11497198002165]
大きな言語モデル(LLM)は、一度のトレーニングのために最新の情報を提供するのに苦労することが多い。
効率的なヒューマンラーニングにおけるFeynman Techniqueの顕著な成功に感銘を受け、セルフチューニングを紹介した。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-06-10T14:42:20Z) - BiomedRAG: A Retrieval Augmented Large Language Model for Biomedicine [19.861178160437827]
大規模言語モデル(LLM)は、バイオメディカルおよび医療分野における様々な応用のための重要なリソースとして急速に現れてきた。
textscBiomedRAGは5つのバイオメディカルNLPタスクで優れたパフォーマンスを実現している。
textscBiomedRAG は、GIT と ChemProt コーパスにおいて、マイクロF1スコアが 81.42 と 88.83 の他のトリプル抽出システムより優れている。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-05-01T12:01:39Z) - Autonomous LLM-driven research from data to human-verifiable research papers [0.0]
完全なステップワイズプロセスを通じてインタラクションをガイドする自動化プラットフォームを構築しています。
注釈付きデータのみを提供するモードでは、データペーパーは仮説を立て、計画を立て、分析コードを書き、解釈し、結果を生成し、解釈した。
我々は、トレーサビリティ、透明性、妥当性を高めながら、AIによる科学的発見の加速の可能性を示す。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-04-24T23:15:49Z) - Agent-based Learning of Materials Datasets from Scientific Literature [0.0]
我々は,大規模言語モデル(LLM)を利用した化学AIエージェントを開発し,自然言語テキストから構造化データセットを作成する。
化学者のAIエージェントであるEunomiaは、何十年もの科学研究論文から既存の知識を活用して、行動を計画し実行することができる。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-12-18T20:29:58Z) - LLMs Accelerate Annotation for Medical Information Extraction [7.743388571513413]
本稿では,LLM(Large Language Models)と人間の専門知識を組み合わせた手法を提案する。
医療情報抽出タスクにおいて,我々の手法を厳格に評価し,我々のアプローチが人的介入を大幅に削減するだけでなく,高い精度を維持していることを示す。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-12-04T19:26:13Z) - Self-Verification Improves Few-Shot Clinical Information Extraction [73.6905567014859]
大規模言語モデル (LLMs) は、数発のテキスト内学習を通じて臨床キュレーションを加速する可能性を示している。
正確性や解釈可能性に関する問題、特に健康のようなミッションクリティカルな領域ではまだ苦戦している。
本稿では,自己検証を用いた汎用的な緩和フレームワークについて検討する。このフレームワークはLLMを利用して,自己抽出のための証明を提供し,その出力をチェックする。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-05-30T22:05:11Z) - Retrieval-Augmented and Knowledge-Grounded Language Models for Faithful Clinical Medicine [68.7814360102644]
本稿では,Re$3$Writer法を提案する。
本手法が患者の退院指示生成に有効であることを示す。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-10-23T16:34:39Z) - BERT WEAVER: Using WEight AVERaging to enable lifelong learning for
transformer-based models in biomedical semantic search engines [49.75878234192369]
We present WEAVER, a simple, yet efficient post-processing method that infuse old knowledge into the new model。
WEAVERを逐次的に適用すると、同じ単語の埋め込み分布が、一度にすべてのデータに対する総合的なトレーニングとして得られることを示す。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-02-21T10:34:41Z)
関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。
指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト(すべての情報・翻訳含む)の品質を保証せず、本サイト(すべての情報・翻訳含む)を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。