論文の概要: Resource Efficient Multi-stain Kidney Glomeruli Segmentation via Self-supervision
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2412.15389v3
- Date: Thu, 30 Oct 2025 16:42:33 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-10-31 16:05:09.234113
- Title: Resource Efficient Multi-stain Kidney Glomeruli Segmentation via Self-supervision
- Title(参考訳): 自己監督による多段階キドニー糸状体セグメンテーションの資源効率
- Authors: Zeeshan Nisar, Friedrich Feuerhake, Thomas Lampert,
- Abstract要約: 本稿では,自己指導型事前学習により,95%少ないラベルでもセグメンテーション手法の性能を維持することができることを示す。
自己教師付き事前トレーニングと5%ラベルの使用では、パフォーマンス低下は最小限である。
これらの結果は、トレーニング分布を超えて、公開ベンチマークデータセットに一般化することが示されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.18352113484137625
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Semantic segmentation under domain shift remains a fundamental challenge in computer vision, particularly when labelled training data is scarce. This challenge is particularly exemplified in histopathology image analysis, where the same tissue structures must be segmented across images captured under different imaging conditions (stains), each representing a distinct visual domain. Traditional deep learning methods like UNet require extensive labels, which is both costly and time-consuming, particularly when dealing with multiple domains (or stains). To mitigate this, various unsupervised domain adaptation based methods such as UDAGAN have been proposed, which reduce the need for labels by requiring only one (source) stain to be labelled. Nonetheless, obtaining source stain labels can still be challenging. This article shows that through self-supervised pre-training -- including SimCLR, BYOL, and a novel approach, HR-CS-CO -- the performance of these segmentation methods (UNet, and UDAGAN) can be retained even with 95% fewer labels. Notably, with self-supervised pre-training and using only 5% labels, the performance drops are minimal: 5.9% for UNet and 6.2% for UDAGAN, averaged over all stains, compared to their respective fully supervised counterparts (without pre-training, using 100% labels). Furthermore, these findings are shown to generalise beyond their training distribution to public benchmark datasets. Implementations and pre-trained models are publicly available \href{https://github.com/zeeshannisar/resource-effecient-multi-stain-kidney-glomeruli-segmentation.git}{online}.
- Abstract(参考訳): ドメインシフトの下でのセマンティックセグメンテーションは、特にラベル付きトレーニングデータが不足している場合、コンピュータビジョンにおける根本的な課題である。
この課題は、組織像解析において特に例示されており、同じ組織構造を異なる画像条件(特定の画像領域)で捉えた画像に分けなければならない。
UNetのような従来のディープラーニング手法では、特に複数のドメイン(または染色)を扱う場合、コストと時間の両方がかかる広範囲なラベルが必要である。
これを軽減するために、UDAGANのような教師なしドメイン適応に基づく様々な手法が提案されている。
それでも、ソースのステンドラベルを取得することは依然として困難である。
この記事では、SimCLR、BYOL、そして新しいアプローチHR-CS-COを含む自己指導型事前トレーニングを通じて、これらのセグメンテーションメソッド(UNet、UDAGAN)のパフォーマンスが95%少ないラベルでも維持可能であることを示す。
特に、自己指導による事前トレーニングと5%のラベルの使用では、パフォーマンス低下は最小限である: UNetが5.9%、UDAGANが6.2%で、それぞれが完全に監督されたラベル(100%ラベルを使用せずに)と比較して、すべての染色の平均値である。
さらに、これらの結果は、トレーニング分布を超えて、公開ベンチマークデータセットに一般化されることが示されている。
実装と事前訓練されたモデルは、 href{https://github.com/zeeshannisar/resource-effecient-multi-stain-kidney-glomeruli-segmentation.git}{online} で公開されている。
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