論文の概要: ADEQA: A Question Answer based approach for joint ADE-Suspect Extraction using Sequence-To-Sequence Transformers
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2412.15510v1
- Date: Fri, 20 Dec 2024 02:48:59 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-12-23 16:21:13.207957
- Title: ADEQA: A Question Answer based approach for joint ADE-Suspect Extraction using Sequence-To-Sequence Transformers
- Title(参考訳): ADEQA:Sequence-to-Sequence Transformerを用いた共同ADE-Suspect抽出のための質問応答に基づくアプローチ
- Authors: Vinayak Arannil, Tomal Deb, Atanu Roy,
- Abstract要約: 本稿では,疑似教師付きラベル付きデータとシーケンス・ツー・シーケンス・トランスフォーマを用いた質問応答(QA)に基づくアプローチであるADEQAを紹介する。
従来のQAモデルとは異なり、自然言語生成(NLG)ベースのモデルは広範なトークンレベルのラベル付けを必要としない。
公的なADEコーパスでは, ADEと被疑者との関係を確立する上で, F1スコアが94%であった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License:
- Abstract: Early identification of Adverse Drug Events (ADE) is critical for taking prompt actions while introducing new drugs into the market. These ADEs information are available through various unstructured data sources like clinical study reports, patient health records, social media posts, etc. Extracting ADEs and the related suspect drugs using machine learning is a challenging task due to the complex linguistic relations between drug ADE pairs in textual data and unavailability of large corpus of labelled datasets. This paper introduces ADEQA, a question-answer(QA) based approach using quasi supervised labelled data and sequence-to-sequence transformers to extract ADEs, drug suspects and the relationships between them. Unlike traditional QA models, natural language generation (NLG) based models don't require extensive token level labelling and thereby reduces the adoption barrier significantly. On a public ADE corpus, we were able to achieve state-of-the-art results with an F1 score of 94% on establishing the relationships between ADEs and the respective suspects.
- Abstract(参考訳): 逆薬物イベント(ADE)の早期発見は、新しい薬物を市場に投入し、迅速な行動を取る上で重要である。
これらのADE情報は、臨床研究報告、患者の健康記録、ソーシャルメディア投稿など、さまざまな構造化されていないデータソースを通じて利用できる。
テキストデータにおける薬物ADEペア間の複雑な言語的関係とラベル付きデータセットの大規模なコーパスの有効性のため、ADEと機械学習を用いた関連する被疑薬物の抽出は難しい課題である。
本稿では,疑似教師付きラベル付きデータとシーケンス・ツー・シーケンス・トランスフォーマーを用いた質問応答(QA)に基づくADEQAを提案する。
従来のQAモデルとは異なり、自然言語生成(NLG)ベースのモデルはトークンレベルのラベリングを必要とせず、採用障壁を大幅に削減する。
公的なADEコーパスでは, ADEと被疑者との関係を確立する上で, F1スコアが94%であった。
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