論文の概要: STARFormer: A Novel Spatio-Temporal Aggregation Reorganization Transformer of FMRI for Brain Disorder Diagnosis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2501.00378v1
- Date: Tue, 31 Dec 2024 10:20:15 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-01-05 17:15:17.566943
- Title: STARFormer: A Novel Spatio-Temporal Aggregation Reorganization Transformer of FMRI for Brain Disorder Diagnosis
- Title(参考訳): STARFormer:脳疾患診断のためのFMRIの新しい時空間集約再構成変換器
- Authors: Wenhao Dong, Yueyang Li, Weiming Zeng, Lei Chen, Hongjie Yan, Wai Ting Siok, Nizhuan Wang,
- Abstract要約: 本稿では,BOLD信号の空間的特徴と時間的特徴を効果的に捉えた時空間集約型ランズフォーマSTAR(Former)を提案する。
提案したSTARFormerは、自閉症スペクトラム障害(ASD)と注意欠陥高活動障害(ADHD)の分類のための2つの公開データセットで厳格に評価されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.222252054627967
- License:
- Abstract: Many existing methods that use functional magnetic resonance imaging (fMRI) classify brain disorders, such as autism spectrum disorder (ASD) and attention deficit hyperactivity disorder (ADHD), often overlook the integration of spatial and temporal dependencies of the blood oxygen level-dependent (BOLD) signals, which may lead to inaccurate or imprecise classification results. To solve this problem, we propose a Spatio-Temporal Aggregation eorganization ransformer (STARFormer) that effectively captures both spatial and temporal features of BOLD signals by incorporating three key modules. The region of interest (ROI) spatial structure analysis module uses eigenvector centrality (EC) to reorganize brain regions based on effective connectivity, highlighting critical spatial relationships relevant to the brain disorder. The temporal feature reorganization module systematically segments the time series into equal-dimensional window tokens and captures multiscale features through variable window and cross-window attention. The spatio-temporal feature fusion module employs a parallel transformer architecture with dedicated temporal and spatial branches to extract integrated features. The proposed STARFormer has been rigorously evaluated on two publicly available datasets for the classification of ASD and ADHD. The experimental results confirm that the STARFormer achieves state-of-the-art performance across multiple evaluation metrics, providing a more accurate and reliable tool for the diagnosis of brain disorders and biomedical research. The codes will be available at: https://github.com/NZWANG/STARFormer.
- Abstract(参考訳): 機能的磁気共鳴イメージング(fMRI)を用いた多くの既存の手法は、自閉症スペクトラム障害(ASD)や注意欠陥高活動障害(ADHD)などの脳障害を分類し、しばしば血液酸素レベル依存(BOLD)信号の空間的および時間的依存関係の統合を見落とし、不正確または不正確な分類結果につながる可能性がある。
そこで本研究では,BOLD信号の空間的特徴と時間的特徴を3つの鍵モジュールを組み込んだ時空間集約型ランズフォーマ(STARFormer)を提案する。
関心領域(ROI)空間構造解析モジュールは、固有ベクトル中心性(EC)を使用して、効果的な接続性に基づいて脳領域を再編成し、脳障害に関連する重要な空間関係を強調する。
時間的特徴再構成モジュールは、時系列を等次元のウィンドウトークンに体系的に分割し、可変ウィンドウとクロスウィンドウアテンションを通してマルチスケール特徴をキャプチャする。
時空間的特徴融合モジュールは、専用の時間的および空間的分岐を持つ並列トランスフォーマーアーキテクチャを用いて、統合された特徴を抽出する。
提案したSTARFormerは、ASDとADHDの分類のために2つの公開データセットで厳格に評価されている。
実験の結果、STARFormerは複数の評価指標で最先端のパフォーマンスを達成し、より正確で信頼性の高い脳疾患の診断ツールとバイオメディカルリサーチを提供することがわかった。
コードは、https://github.com/NZWANG/STARFormer.comから入手できる。
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