論文の概要: Large Language-Geometry Model: When LLM meets Equivariance
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2502.11149v2
- Date: Wed, 19 Feb 2025 06:41:42 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-02-20 14:01:12.744419
- Title: Large Language-Geometry Model: When LLM meets Equivariance
- Title(参考訳): 大規模言語幾何学モデル:LLMが等分散を満たすとき
- Authors: Zongzhao Li, Jiacheng Cen, Bing Su, Wenbing Huang, Tingyang Xu, Yu Rong, Deli Zhao,
- Abstract要約: 本稿では,3次元物理システムを表現するための新しいフレームワークであるEquiLLMを提案する。
EquiLLMは分子動力学シミュレーション,ヒトの動作シミュレーション,抗体設計など,従来の手法よりも大幅に改善されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 53.8505081745406
- License:
- Abstract: Accurately predicting 3D structures and dynamics of physical systems is crucial in scientific applications. Existing approaches that rely on geometric Graph Neural Networks (GNNs) effectively enforce $\mathrm{E}(3)$-equivariance, but they often fall in leveraging extensive broader information. While direct application of Large Language Models (LLMs) can incorporate external knowledge, they lack the capability for spatial reasoning with guaranteed equivariance. In this paper, we propose EquiLLM, a novel framework for representing 3D physical systems that seamlessly integrates E(3)-equivariance with LLM capabilities. Specifically, EquiLLM comprises four key components: geometry-aware prompting, an equivariant encoder, an LLM, and an equivariant adaptor. Essentially, the LLM guided by the instructive prompt serves as a sophisticated invariant feature processor, while 3D directional information is exclusively handled by the equivariant encoder and adaptor modules. Experimental results demonstrate that EquiLLM delivers significant improvements over previous methods across molecular dynamics simulation, human motion simulation, and antibody design, highlighting its promising generalizability.
- Abstract(参考訳): 物理系の3次元構造と力学を正確に予測することは科学応用において重要である。
幾何グラフニューラルネットワーク(GNN)に依存する既存のアプローチは、$\mathrm{E}(3)$-equivariance(英語版)を効果的に強制するが、より広範な情報を活用することに失敗することが多い。
LLM(Large Language Models)の直接適用は外部知識を組み込むことができるが、等値性を保証する空間推論能力は欠如している。
本稿では,LLM機能とE(3)-equivarianceをシームレスに統合した3次元物理系を表現する新しいフレームワークであるEquiLLMを提案する。
具体的には、EquiLLMは、幾何認識プロンプト、同変エンコーダ、LLM、同変アダプタの4つのキーコンポーネントから構成される。
基本的に、インストラクティブプロンプトによって導かれるLCMは洗練された不変機能プロセッサとして機能し、3次元方向情報は同変エンコーダとアダプタモジュールによってのみ扱われる。
実験により,EquiLLMは分子動力学シミュレーション,ヒトの運動シミュレーション,抗体設計など,従来の手法よりも大幅に改善され,期待できる一般化性を強調した。
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