論文の概要: Deep Learning-Based Diffusion MRI Tractography: Integrating Spatial and Anatomical Information
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2503.03329v1
- Date: Wed, 05 Mar 2025 10:02:35 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-03-06 15:51:17.657857
- Title: Deep Learning-Based Diffusion MRI Tractography: Integrating Spatial and Anatomical Information
- Title(参考訳): 深層学習に基づく拡散MRIトラクトグラフィー : 空間情報と解剖情報の統合
- Authors: Yiqiong Yang, Yitian Yuan, Baoxing Ren, Ye Wu, Yanqiu Feng, Xinyuan Zhang,
- Abstract要約: 拡散MRI法は、脳内の白質経路を非侵襲的に可視化することを可能にする。
神経科学や臨床分野で重要な役割を担い、脳の接続性や神経疾患の研究を促進する。
深層学習法は、ホワイトマターのカバレッジを改善するためにトラクトグラムを改善するために応用されてきたが、しばしば過剰な偽陽性接続を発生させることに費やされる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.669798532124614
- License:
- Abstract: Diffusion MRI tractography technique enables non-invasive visualization of the white matter pathways in the brain. It plays a crucial role in neuroscience and clinical fields by facilitating the study of brain connectivity and neurological disorders. However, the accuracy of reconstructed tractograms has been a longstanding challenge. Recently, deep learning methods have been applied to improve tractograms for better white matter coverage, but often comes at the expense of generating excessive false-positive connections. This is largely due to their reliance on local information to predict long range streamlines. To improve the accuracy of streamline propagation predictions, we introduce a novel deep learning framework that integrates image-domain spatial information and anatomical information along tracts, with the former extracted through convolutional layers and the later modeled via a Transformer-decoder. Additionally, we employ a weighted loss function to address fiber class imbalance encountered during training. We evaluate the proposed method on the simulated ISMRM 2015 Tractography Challenge dataset, achieving a valid streamline rate of 66.2%, white matter coverage of 63.8%, and successfully reconstructing 24 out of 25 bundles. Furthermore, on the multi-site Tractoinferno dataset, the proposed method demonstrates its ability to handle various diffusion MRI acquisition schemes, achieving a 5.7% increase in white matter coverage and a 4.1% decrease in overreach compared to RNN-based methods.
- Abstract(参考訳): 拡散MRI法は、脳内の白質経路を非侵襲的に可視化することを可能にする。
神経科学や臨床分野で重要な役割を担い、脳の接続性や神経疾患の研究を促進する。
しかし, 再建したトラクトグラムの精度は長年にわたる課題である。
近年, 深層学習法がトラクトグラムの改良に応用されているが, 過剰な偽陽性接続を発生させることがしばしばある。
これは主に、長距離の流線型を予測するためのローカル情報に依存しているためである。
画像領域の空間情報と解剖情報をトラクションに沿って統合し,前者は畳み込み層から抽出し,後者はトランスフォーマーデコーダでモデル化した。
さらに、トレーニング中に遭遇したファイバクラスの不均衡に対処するために、重み付き損失関数を用いる。
In this method on thesimulated ISMRM 2015 Tractography Challenge dataset, achieved a valid streamline rate of 66.2%, white matter coverage of 63.8%, and successfully restructing 24 of 25 bundles。
さらに, マルチサイトTractoinfernoデータセットでは, 様々な拡散MRI取得方式の処理能力を示し, ホワイトマターのカバレッジが5.7%増加し, オーバーリーチが4.1%減少した。
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