論文の概要: Predicting Survivability of Cancer Patients with Metastatic Patterns Using Explainable AI
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2504.06306v1
- Date: Mon, 07 Apr 2025 20:48:15 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-04-10 13:05:37.234888
- Title: Predicting Survivability of Cancer Patients with Metastatic Patterns Using Explainable AI
- Title(参考訳): 説明可能なAIを用いた転移パターンを有するがん患者の生存予測
- Authors: Polycarp Nalela, Deepthi Rao, Praveen Rao,
- Abstract要約: 本研究は、転移パターンを有するがん患者の生存可能性を予測するために機械学習(ML)を活用する。
MSK-METデータセットには、27種類のがんの25,775人のゲノムおよび臨床データが含まれている。
XGBoost は曲線 (AUC) が 0.82 である最高のパフォーマーとして登場した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.6182192515316247
- License:
- Abstract: Cancer remains a leading global health challenge and a major cause of mortality. This study leverages machine learning (ML) to predict the survivability of cancer patients with metastatic patterns using the comprehensive MSK-MET dataset, which includes genomic and clinical data from 25,775 patients across 27 cancer types. We evaluated five ML models-XGBoost, Na\"ive Bayes, Decision Tree, Logistic Regression, and Random Fores using hyperparameter tuning and grid search. XGBoost emerged as the best performer with an area under the curve (AUC) of 0.82. To enhance model interpretability, SHapley Additive exPlanations (SHAP) were applied, revealing key predictors such as metastatic site count, tumor mutation burden, fraction of genome altered, and organ-specific metastases. Further survival analysis using Kaplan-Meier curves, Cox Proportional Hazards models, and XGBoost Survival Analysis identified significant predictors of patient outcomes, offering actionable insights for clinicians. These findings could aid in personalized prognosis and treatment planning, ultimately improving patient care.
- Abstract(参考訳): がんは依然として世界的な健康上の課題であり、大きな死因である。
本研究は機械学習を用いて,27種類のがん患者25,775人のゲノム・臨床データを含む総合的なMSK-METデータセットを用いて,転移パターンを有するがん患者の生存可能性を予測する。
我々は、ハイパーパラメータチューニングとグリッドサーチを用いて、XGBoost、Na\"ive Bayes、Decision Tree、Logistic Regression、Random Foresの5つのMLモデルを評価した。
XGBoost は曲線 (AUC) が 0.82 である最高のパフォーマーとして登場した。
モデル解釈性を高めるため,SHAP (SHapley Additive exPlanations) を応用し,転移部位数,腫瘍突然変異負担,ゲノム断片の変化,臓器特異的な転移などの重要な予測因子を明らかにした。
Kaplan-Meier曲線, Cox Proportional Hazardsモデル, XGBoost Survival Analysis を用いたさらなる生存分析により, 患者の予後の有意な予測因子が同定された。
これらの発見は、パーソナライズされた予後と治療計画に役立ち、最終的には患者のケアを改善する。
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