論文の概要: Giving Simulated Cells a Voice: Evolving Prompt-to-Intervention Models for Cellular Control
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2505.02766v1
- Date: Mon, 05 May 2025 16:21:46 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-05-06 18:49:35.74047
- Title: Giving Simulated Cells a Voice: Evolving Prompt-to-Intervention Models for Cellular Control
- Title(参考訳): シミュレーションされた細胞に声を与える:細胞制御のためのプロンプト・ツー・インターベンションモデル
- Authors: Nam H. Le, Patrick Erikson, Yanbo Zhang, Michael Levin, Josh Bongard,
- Abstract要約: 大規模言語モデル(LLM)は、AIシステムにおける解釈可能な制御のためのインタフェースとして自然言語を可能にした。
本稿では,自然言語のプロンプトをシミュレートされたセル集合を誘導できる空間ベクトル場に変換する機能パイプラインを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.7056803236939193
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
- Abstract: Guiding biological systems toward desired states, such as morphogenetic outcomes, remains a fundamental challenge with far-reaching implications for medicine and synthetic biology. While large language models (LLMs) have enabled natural language as an interface for interpretable control in AI systems, their use as mediators for steering biological or cellular dynamics remains largely unexplored. In this work, we present a functional pipeline that translates natural language prompts into spatial vector fields capable of directing simulated cellular collectives. Our approach combines a large language model with an evolvable neural controller (Prompt-to-Intervention, or P2I), optimized via evolutionary strategies to generate behaviors such as clustering or scattering in a simulated 2D environment. We demonstrate that even with constrained vocabulary and simplified cell models, evolved P2I networks can successfully align cellular dynamics with user-defined goals expressed in plain language. This work offers a complete loop from language input to simulated bioelectric-like intervention to behavioral output, providing a foundation for future systems capable of natural language-driven cellular control.
- Abstract(参考訳): 形態形成の結果など、望まれる状態に向けて生物学的システムを導くことは、医学や合成生物学に大きく影響する上での根本的な課題である。
大規模言語モデル(LLM)は、AIシステムの解釈可能な制御のためのインタフェースとして自然言語を有効にしているが、生体や細胞力学を操る仲介者としての利用は、いまだに探索されていない。
本研究では、自然言語のプロンプトを、シミュレーションされたセル集合を誘導できる空間ベクトル場に変換する機能パイプラインを提案する。
我々のアプローチは、大規模言語モデルと進化可能なニューラルコントローラ(Prompt-to-Intervention, P2I)を組み合わせることで、シミュレーションされた2D環境でのクラスタリングや散乱などの振る舞いを生成する。
制約付き語彙と単純化されたセルモデルであっても、進化したP2Iネットワークは、平易な言語で表現されたユーザ定義の目標とセルダイナミクスをうまく整合させることができることを示す。
この研究は、言語入力から生体電気的にシミュレーションされた行動出力への介入までの完全なループを提供し、自然言語駆動の細胞制御が可能な将来のシステムの基礎を提供する。
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