論文の概要: Machine Learning Derived Blood Input for Dynamic PET Images of Rat Heart
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2505.15488v1
- Date: Wed, 21 May 2025 13:10:44 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-05-22 15:42:59.651759
- Title: Machine Learning Derived Blood Input for Dynamic PET Images of Rat Heart
- Title(参考訳): ラット心臓の動的PET画像に対する機械学習による血液入力
- Authors: Shubhrangshu Debsarkar, Bijoy Kundu,
- Abstract要約: ラット心臓の動的FDG PET画像に対するMCIFと運動速度定数の同時推定のための二重出力モデルを開発した。
半自動セグメンテーションを用いて,IDIFと心筋入力の結合を用いて,テストデータ中のMCIFをトレーニングし,予測するLong-Short-Term Memory (LSTM) セルネットワークを構築した。
モデルミッドポイントは以前の平均正方形誤差(MSE)よりも56.4%改善することができた。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Dynamic FDG PET imaging study of n = 52 rats including 26 control Wistar-Kyoto (WKY) rats and 26 experimental spontaneously hypertensive rats (SHR) were performed using a Siemens microPET and Albira trimodal scanner longitudinally at 1, 2, 3, 5, 9, 12 and 18 months of age. A 15-parameter dual output model correcting for spill over contamination and partial volume effects with peak fitting cost functions was developed for simultaneous estimation of model corrected blood input function (MCIF) and kinetic rate constants for dynamic FDG PET images of rat heart in vivo. Major drawbacks of this model are its dependence on manual annotations for the Image Derived Input Function (IDIF) and manual determination of crucial model parameters to compute MCIF. To overcome these limitations, we performed semi-automated segmentation and then formulated a Long-Short-Term Memory (LSTM) cell network to train and predict MCIF in test data using a concatenation of IDIFs and myocardial inputs and compared them with reference-modeled MCIF. Thresholding along 2D plane slices with two thresholds, with T1 representing high-intensity myocardium, and T2 representing lower-intensity rings, was used to segment the area of the LV blood pool. The resultant IDIF and myocardial TACs were used to compute the corresponding reference (model) MCIF for all data sets. The segmented IDIF and the myocardium formed the input for the LSTM network. A k-fold cross validation structure with a 33:8:11 split and 5 folds was utilized to create the model and evaluate the performance of the LSTM network for all datasets. To overcome the sparseness of data as time steps increase, midpoint interpolation was utilized to increase the density of datapoints beyond time = 10 minutes. The model utilizing midpoint interpolation was able to achieve a 56.4% improvement over previous Mean Squared Error (MSE).
- Abstract(参考訳): Siemens microPETとAlbira trimodal scannerを縦に1, 2, 3, 5, 9, 9, 12, 18カ月で使用し, コントロールWistar-Kyoto(WKY)ラット26例と実験的自然発症高血圧ラット(SHR)26例を含むn=52ラットの動的FDG PET画像解析を行った。
ラット心の動的FDG PET画像に対するMCIFと運動速度定数を同時推定するために, 汚染汚染に対する15パラメータ二重出力モデルとピーク適合コスト関数による部分体積効果の補正法を開発した。
このモデルの主な欠点は、画像導出入力関数(IDIF)のマニュアルアノテーションに依存し、MCIFを計算するために重要なモデルパラメータを手動で決定することである。
これらの制限を克服するため,我々はセミオートマチックセグメンテーションを行い,テストデータ中のMCIFのトレーニングと予測を行うLong-Short-Term Memory (LSTM) セルネットワークを構築し,参照型MCIFと比較した。
T1は高強度心筋、T2は低強度リング、T2はLV血液プールの面積を区切るために2次元平面スライスに沿って保持した。
結果として得られたIDIFと心筋TACは,すべてのデータセットに対して対応する参照(モデル)MCIFを計算するのに用いられた。
セグメント化されたIDIFと心筋はLSTMネットワークの入力を形成した。
33:8:11の分割と5の折り畳みを持つk-foldクロスバリデーション構造を用いて、モデルを作成し、全てのデータセットに対してLSTMネットワークの性能を評価する。
時間ステップが増加するにつれてデータのスパース性を克服するため、中間点補間を用いてデータポイントの密度を10分以上増加させた。
中点補間を利用したモデルは、以前の平均正方形誤差(MSE)よりも56.4%改善することができた。
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