論文の概要: DeepMultiConnectome: Deep Multi-Task Prediction of Structural Connectomes Directly from Diffusion MRI Tractography
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2505.22685v2
- Date: Wed, 11 Jun 2025 08:09:20 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-06-13 02:07:43.221781
- Title: DeepMultiConnectome: Deep Multi-Task Prediction of Structural Connectomes Directly from Diffusion MRI Tractography
- Title(参考訳): DeepMultiConnectome:拡散MRIによる構造コネクトームのマルチタスク予測
- Authors: Marcus J. Vroemen, Yuqian Chen, Yui Lo, Tengfei Xue, Weidong Cai, Fan Zhang, Josien P. W. Pluim, Lauren J. O'Donnell,
- Abstract要約: 本稿では,構造コネクトームを直接トラクトグラフィーから予測するディープラーニングモデルであるDeepMultiConnectomeを紹介する。
マルチタスク学習を備えたポイントクラウドベースのニューラルネットワークを使用して、モデルは、接続されたリージョンに応じて、ストリームラインを分類する。
DeepMultiConnectomeは、予測されたコネクトームと従来のストリーラインのラベル付け法を用いて生成された従来のコネクトームを比較して評価する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.182205565362745
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Diffusion MRI (dMRI) tractography enables in vivo mapping of brain structural connections, but traditional connectome generation is time-consuming and requires gray matter parcellation, posing challenges for large-scale studies. We introduce DeepMultiConnectome, a deep-learning model that predicts structural connectomes directly from tractography, bypassing the need for gray matter parcellation while supporting multiple parcellation schemes. Using a point-cloud-based neural network with multi-task learning, the model classifies streamlines according to their connected regions across two parcellation schemes, sharing a learned representation. We train and validate DeepMultiConnectome on tractography from the Human Connectome Project Young Adult dataset ($n = 1000$), labeled with an 84 and 164 region gray matter parcellation scheme. DeepMultiConnectome predicts multiple structural connectomes from a whole-brain tractogram containing 3 million streamlines in approximately 40 seconds. DeepMultiConnectome is evaluated by comparing predicted connectomes with traditional connectomes generated using the conventional method of labeling streamlines using a gray matter parcellation. The predicted connectomes are highly correlated with traditionally generated connectomes ($r = 0.992$ for an 84-region scheme; $r = 0.986$ for a 164-region scheme) and largely preserve network properties. A test-retest analysis of DeepMultiConnectome demonstrates reproducibility comparable to traditionally generated connectomes. The predicted connectomes perform similarly to traditionally generated connectomes in predicting age and cognitive function. Overall, DeepMultiConnectome provides a scalable, fast model for generating subject-specific connectomes across multiple parcellation schemes.
- Abstract(参考訳): 拡散MRI(dMRI)トラクトグラフィーは脳の構造的接続の生体内マッピングを可能にするが、従来のコネクトーム生成には時間がかかり、グレーマターのパーセレーションが必要であり、大規模研究の課題となっている。
我々は,複数パーセレーションスキームをサポートしながら,灰白質パーセレーションの必要性を回避し,トラクトグラフィーから直接構造的コネクトームを予測するディープラーニングモデルであるDeepMultiConnectomeを紹介する。
マルチタスク学習を備えたポイントクラウドベースのニューラルネットワークを使用して、モデルは2つのパーセレーションスキームにまたがって、接続された領域に応じてストリームラインを分類し、学習された表現を共有する。
我々は,Human Connectome Project Young Adult dataset(n = 1000$)のトラクトグラフィーでDeepMultiConnectomeを訓練し,評価した。
DeepMultiConnectomeは、約40秒で300万のストリームラインを含む全脳トラクグラムから複数の構造的コネクトームを予測する。
DeepMultiConnectomeは、グレーマターパーセレーションを用いた従来のストリープラインのラベル付け法を用いて、予測されたコネクトームと従来のコネクトームを比較して評価する。
予測されたコネクトームは、伝統的に生成されたコネクトーム(84リージョンスキームは0.992$、$r = 0.986$、164リージョンスキームは0.986$)と高い相関関係を持ち、ネットワーク特性を保っている。
DeepMultiConnectomeのテスト再テスト分析は、伝統的に生成されたコネクトームに匹敵する再現性を示している。
予測されたコネクトームは、年齢や認知機能を予測するために伝統的に生成されたコネクトームと同様に機能する。
全体として、DeepMultiConnectomeは、複数のパーセレーションスキームにまたがる主題固有のコネクトームを生成する、スケーラブルで高速なモデルを提供する。
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