論文の概要: petBrain: A New Pipeline for Amyloid, Tau Tangles and Neurodegeneration Quantification Using PET and MRI
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2506.03217v1
- Date: Tue, 03 Jun 2025 07:44:04 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-06-05 21:20:13.956578
- Title: petBrain: A New Pipeline for Amyloid, Tau Tangles and Neurodegeneration Quantification Using PET and MRI
- Title(参考訳): petBrain : PETとMRIによるアミロイド, タウタングルス, 神経変性の定量化
- Authors: Pierrick Coupé, Boris Mansencal, Floréal Morandat, Sergio Morell-Ortega, Nicolas Villain, Jose V. Manjón, Vincent Planche,
- Abstract要約: PETとMRIを用いたアミロイド(A), 神経原線維タングル(T2), 神経変性(N)の定量化は, アルツハイマー病の診断と予後に重要である。
既存のパイプラインは、トレーサタイプの処理時間の変動に関する制限に直面している。
我々は,アミロイドPET,タウPET,構造MRIのための新しいエンドツーエンド処理パイプラインである petBrain を開発した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: INTRODUCTION: Quantification of amyloid plaques (A), neurofibrillary tangles (T2), and neurodegeneration (N) using PET and MRI is critical for Alzheimer's disease (AD) diagnosis and prognosis. Existing pipelines face limitations regarding processing time, variability in tracer types, and challenges in multimodal integration. METHODS: We developed petBrain, a novel end-to-end processing pipeline for amyloid-PET, tau-PET, and structural MRI. It leverages deep learning-based segmentation, standardized biomarker quantification (Centiloid, CenTauR, HAVAs), and simultaneous estimation of A, T2, and N biomarkers. The pipeline is implemented as a web-based platform, requiring no local computational infrastructure or specialized software knowledge. RESULTS: petBrain provides reliable and rapid biomarker quantification, with results comparable to existing pipelines for A and T2. It shows strong concordance with data processed in ADNI databases. The staging and quantification of A/T2/N by petBrain demonstrated good agreement with CSF/plasma biomarkers, clinical status, and cognitive performance. DISCUSSION: petBrain represents a powerful and openly accessible platform for standardized AD biomarker analysis, facilitating applications in clinical research.
- Abstract(参考訳): PETとMRIを用いたアミロイドプラーク(A), 神経原線維タングル(T2), 神経変性(N)の定量化はアルツハイマー病(AD)の診断と予後に重要である。
既存のパイプラインは、処理時間、トレーサタイプの多様性、マルチモーダル統合における課題に関する制限に直面している。
Methods: petBrainはアミロイドPET, tau-PET, 構造MRIのための新しいエンドツーエンド処理パイプラインである。
ディープラーニングに基づくセグメンテーション、標準化されたバイオマーカー量化(Centiloid、CenTauR、HAVAs)、A、T2、Nのバイオマーカーの同時推定を活用する。
パイプラインはWebベースのプラットフォームとして実装されており、ローカルな計算インフラや専門的なソフトウェア知識を必要としない。
RESULTS: petBrainは、AとT2の既存のパイプラインに匹敵する信頼性と迅速なバイオマーカーの定量化を提供する。
ADNIデータベースで処理されたデータと強く一致している。
ペットブラインによるA/T2/Nのステージングと定量化は, CSF/プラスマバイオマーカー, 臨床状態, 認知能力と良好な一致を示した。
DisCUSSION: petBrainは、ADバイオマーカー分析の標準化のための強力でオープンなプラットフォームであり、臨床研究における応用を促進する。
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