論文の概要: SynBridge: Bridging Reaction States via Discrete Flow for Bidirectional Reaction Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2507.08475v1
- Date: Fri, 11 Jul 2025 10:35:13 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-07-14 18:03:54.325526
- Title: SynBridge: Bridging Reaction States via Discrete Flow for Bidirectional Reaction Prediction
- Title(参考訳): SynBridge: 双方向反応予測のための離散流によるブリジング反応状態
- Authors: Haitao Lin, Junjie Wang, Zhifeng Gao, Xiaohong Ji, Rong Zhu, Linfeng Zhang, Guolin Ke, Weinan E,
- Abstract要約: 化学反応の本質は電子の再分配と再編成にある。
マルチタスク反応予測を実現するための双方向フローベース生成モデルであるSynBridgeを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 33.428877102021254
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: The essence of a chemical reaction lies in the redistribution and reorganization of electrons, which is often manifested through electron transfer or the migration of electron pairs. These changes are inherently discrete and abrupt in the physical world, such as alterations in the charge states of atoms or the formation and breaking of chemical bonds. To model the transition of states, we propose SynBridge, a bidirectional flow-based generative model to achieve multi-task reaction prediction. By leveraging a graph-to-graph transformer network architecture and discrete flow bridges between any two discrete distributions, SynBridge captures bidirectional chemical transformations between graphs of reactants and products through the bonds' and atoms' discrete states. We further demonstrate the effectiveness of our method through extensive experiments on three benchmark datasets (USPTO-50K, USPTO-MIT, Pistachio), achieving state-of-the-art performance in both forward and retrosynthesis tasks. Our ablation studies and noise scheduling analysis reveal the benefits of structured diffusion over discrete spaces for reaction prediction.
- Abstract(参考訳): 化学反応の本質は電子の再分配と再編成にあり、電子移動や電子対の移動によってしばしば現れる。
これらの変化は本質的には離散的であり、原子の電荷状態の変化や化学結合の形成や崩壊などの物理的世界で急激なものである。
状態の遷移をモデル化するために,多タスク反応予測を実現する双方向フローベース生成モデルであるSynBridgeを提案する。
グラフ-グラフ変換器ネットワークアーキテクチャと2つの離散分布間の離散フローブリッジを利用することで、SynBridgeは結合と原子の離散状態を介して反応物のグラフと生成物の間の双方向の化学変換をキャプチャする。
さらに,3つのベンチマークデータセット (USPTO-50K, USPTO-MIT, Pistachio) を用いた広範囲な実験により, 先行および後続の合成タスクにおける最先端性能を実現することにより, 本手法の有効性を実証した。
我々のアブレーション研究とノイズスケジューリング分析は、反応予測のための離散空間上の構造拡散の利点を明らかにする。
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