論文の概要: DENSE: Longitudinal Progress Note Generation with Temporal Modeling of Heterogeneous Clinical Notes Across Hospital Visits
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2507.14079v1
- Date: Fri, 18 Jul 2025 17:00:27 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-07-21 20:43:26.368145
- Title: DENSE: Longitudinal Progress Note Generation with Temporal Modeling of Heterogeneous Clinical Notes Across Hospital Visits
- Title(参考訳): DENSE: 病院訪問における異種臨床ノートの時間的モデリングによる経時的進歩ノートの作成
- Authors: Garapati Keerthana, Manik Gupta,
- Abstract要約: プログレッシブノートは電子健康記録で最も臨床的に意味のあるアーティファクトの1つである。
その重要性にもかかわらず、それらは大規模なEHRデータセットでは不足している。
DENSEは、医師が過去の出会いを参照する方法をシミュレートすることで、臨床文書と整合するように設計されたシステムである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.1578515540930834
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Progress notes are among the most clinically meaningful artifacts in an Electronic Health Record (EHR), offering temporally grounded insights into a patient's evolving condition, treatments, and care decisions. Despite their importance, they are severely underrepresented in large-scale EHR datasets. For instance, in the widely used Medical Information Mart for Intensive Care III (MIMIC-III) dataset, only about $8.56\%$ of hospital visits include progress notes, leaving gaps in longitudinal patient narratives. In contrast, the dataset contains a diverse array of other note types, each capturing different aspects of care. We present DENSE (Documenting Evolving Progress Notes from Scattered Evidence), a system designed to align with clinical documentation workflows by simulating how physicians reference past encounters while drafting progress notes. The system introduces a fine-grained note categorization and a temporal alignment mechanism that organizes heterogeneous notes across visits into structured, chronological inputs. At its core, DENSE leverages a clinically informed retrieval strategy to identify temporally and semantically relevant content from both current and prior visits. This retrieved evidence is used to prompt a large language model (LLM) to generate clinically coherent and temporally aware progress notes. We evaluate DENSE on a curated cohort of patients with multiple visits and complete progress note documentation. The generated notes demonstrate strong longitudinal fidelity, achieving a temporal alignment ratio of $1.089$, surpassing the continuity observed in original notes. By restoring narrative coherence across fragmented documentation, our system supports improved downstream tasks such as summarization, predictive modeling, and clinical decision support, offering a scalable solution for LLM-driven note synthesis in real-world healthcare settings.
- Abstract(参考訳): エレクトロニック・ヘルス・レコーズ(Electronic Health Record, EHR)は、患者の進化する状態、治療、およびケアの決定について、時間的に根ざした洞察を提供する電子健康記録(Electronic Health Record, EHR)の中で、最も臨床的に有意義なアーティファクトの一つである。
その重要性にも拘わらず、大規模なEHRデータセットでは著しく不足している。
例えば、MIMIC-IIIデータセット(MIMIC-III)で広く使われている医療情報マート(英語版)では、病院訪問の約8.56 %が進行ノートを含み、患者の縦断的な物語にギャップを残している。
対照的にデータセットには、さまざまな種類のノートタイプが含まれており、それぞれがケアのさまざまな側面をキャプチャしている。
DENSE (Documenting Evolving Progress Notes from Scattered Evidence) は、医師が経過ノートを作成しながら過去の出会いを参照する方法をシミュレートすることによって、臨床ドキュメントワークフローと整合するように設計されたシステムである。
このシステムでは、詳細な音符分類と時間的アライメント機構を導入し、訪問中の異種音符を構造化された時系列入力に整理する。
DENSEの中核は、臨床的に情報を得た検索戦略を利用して、現在および過去の訪問から、時間的および意味的に関連のあるコンテンツを識別する。
この証拠は、大規模言語モデル(LLM)に臨床的に一貫性があり、時間的に認識される進歩ノートを生成するよう促すために用いられる。
複数回来院した患者のコホートでDENSEを評価した。
生成された音符は強い縦長の忠実さを示し、時間的アライメント比は1.089$であり、原音で観測された連続性を超えている。
断片化された文書間での物語コヒーレンスを復元することにより,要約,予測モデリング,臨床決定支援などの下流タスクの改善をサポートし,現実の医療環境におけるLCM駆動ノート合成のためのスケーラブルなソリューションを提供する。
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