論文の概要: A Study of Anatomical Priors for Deep Learning-Based Segmentation of Pheochromocytoma in Abdominal CT
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2507.15193v1
- Date: Mon, 21 Jul 2025 02:35:29 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-07-22 20:51:32.231988
- Title: A Study of Anatomical Priors for Deep Learning-Based Segmentation of Pheochromocytoma in Abdominal CT
- Title(参考訳): 腹部CTにおける深層学習による褐色細胞腫の鑑別に関する解剖学的検討
- Authors: Tanjin Taher Toma, Tejas Sudharshan Mathai, Bikash Santra, Pritam Mukherjee, Jianfei Liu, Wesley Jong, Darwish Alabyad, Vivek Batheja, Abhishek Jha, Mayank Patel, Darko Pucar, Jayadira del Rivero, Karel Pacak, Ronald M. Summers,
- Abstract要約: 本研究は,深層学習に基づくPCCセグメンテーションを改善する構成を特定するために,解剖学的先行を体系的に評価する。
フェオクロモサイトーマの正確な3次元セグメンテーションのための11のアノテーション戦略を評価するためにnnU-Netフレームワークを使用した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.2784582049471505
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Accurate segmentation of pheochromocytoma (PCC) in abdominal CT scans is essential for tumor burden estimation, prognosis, and treatment planning. It may also help infer genetic clusters, reducing reliance on expensive testing. This study systematically evaluates anatomical priors to identify configurations that improve deep learning-based PCC segmentation. We employed the nnU-Net framework to evaluate eleven annotation strategies for accurate 3D segmentation of pheochromocytoma, introducing a set of novel multi-class schemes based on organ-specific anatomical priors. These priors were derived from adjacent organs commonly surrounding adrenal tumors (e.g., liver, spleen, kidney, aorta, adrenal gland, and pancreas), and were compared against a broad body-region prior used in previous work. The framework was trained and tested on 105 contrast-enhanced CT scans from 91 patients at the NIH Clinical Center. Performance was measured using Dice Similarity Coefficient (DSC), Normalized Surface Distance (NSD), and instance-wise F1 score. Among all strategies, the Tumor + Kidney + Aorta (TKA) annotation achieved the highest segmentation accuracy, significantly outperforming the previously used Tumor + Body (TB) annotation across DSC (p = 0.0097), NSD (p = 0.0110), and F1 score (25.84% improvement at an IoU threshold of 0.5), measured on a 70-30 train-test split. The TKA model also showed superior tumor burden quantification (R^2 = 0.968) and strong segmentation across all genetic subtypes. In five-fold cross-validation, TKA consistently outperformed TB across IoU thresholds (0.1 to 0.5), reinforcing its robustness and generalizability. These findings highlight the value of incorporating relevant anatomical context in deep learning models to achieve precise PCC segmentation, supporting clinical assessment and longitudinal monitoring.
- Abstract(参考訳): 腹部CT検査における褐色細胞腫 (PCC) の正確な分画は, 腫瘍の負担評価, 予後, 治療計画に不可欠である。
また、遺伝子クラスターの推測にも役立ち、高価な検査への依存を減らすことができる。
本研究は,深層学習に基づくPCCセグメンテーションを改善するための構成を特定するために,解剖学的先行を体系的に評価する。
我々は,nU-Netフレームワークを用いて,臓器特異的な解剖学的前駆体に基づく新しいマルチクラススキームを導入し,褐色細胞腫の正確な3Dセグメンテーションのための11のアノテーション戦略を評価した。
これらの先行は, 副腎腫瘍(肝臓, 脾臓, 腎臓, 大動脈, 副腎, 膵臓など)を包含する隣接臓器から発生し, 以前の研究で使用されていた広範囲の組織領域と比較した。
NIHクリニカルセンターで91例の造影CTで105例の検査を行った。
Dice similarity Coefficient (DSC), Normalized Surface Distance (NSD), instance-wise F1 score。
すべての戦略の中で、腫瘍+キドニー+オータ(TKA)アノテーションは最も高いセグメンテーション精度を達成し、70-30の列車試験で測定されたDSC(p = 0.0097)、NSD(p = 0.0110)、F1スコア(0.5のIoU閾値で25.84%改善)をはるかに上回った。
また,TKAモデルでは腫瘍負担量(R^2 = 0.968)が優れ,全ての遺伝子サブタイプに強いセグメンテーションが認められた。
5倍のクロスバリデーションでは、TKAは一貫してIoU閾値(0.1から0.5)でTBを上回っ、その堅牢性と一般化性を高めた。
これらの知見は,PCCセグメンテーションを正確に達成し,臨床評価と経時的モニタリングを支援するために,深層学習モデルに関連する解剖学的文脈を取り入れることの価値を強調した。
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