論文の概要: Agent-Based Feature Generation from Clinical Notes for Outcome Prediction

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2508.01956v1
• Date: Sun, 03 Aug 2025 23:45:18 GMT
• ステータス: 翻訳完了
• システム内更新日: 2025-08-05 18:25:22.130078
• Title: Agent-Based Feature Generation from Clinical Notes for Outcome Prediction
• Title（参考訳）: アウトカム予測のための臨床ノートからのエージェントベース特徴生成
• Abstract要約: 大規模言語モデル(LLM)を利用したモジュール型マルチエージェントシステムであるSNOWを導入する。 SNOWは,Stanford Healthcareの147例において,手動CFG,クリニカルガイド下LCM法,RFG法を用いて5年間の前立腺癌再発の予測を行った。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 4.5134876868616765
• License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
• Abstract: Electronic health records (EHRs) contain rich unstructured clinical notes that could enhance predictive modeling, yet extracting meaningful features from these notes remains challenging. Current approaches range from labor-intensive manual clinician feature generation (CFG) to fully automated representational feature generation (RFG) that lack interpretability and clinical relevance. Here we introduce SNOW (Scalable Note-to-Outcome Workflow), a modular multi-agent system powered by large language models (LLMs) that autonomously generates structured clinical features from unstructured notes without human intervention. We evaluated SNOW against manual CFG, clinician-guided LLM approaches, and RFG methods for predicting 5-year prostate cancer recurrence in 147 patients from Stanford Healthcare. While manual CFG achieved the highest performance (AUC-ROC: 0.771), SNOW matched this performance (0.761) without requiring any clinical expertise, significantly outperforming both baseline features alone (0.691) and all RFG approaches. The clinician-guided LLM method also performed well (0.732) but still required expert input. SNOW's specialized agents handle feature discovery, extraction, validation, post-processing, and aggregation, creating interpretable features that capture complex clinical information typically accessible only through manual review. Our findings demonstrate that autonomous LLM systems can replicate expert-level feature engineering at scale, potentially transforming how clinical ML models leverage unstructured EHR data while maintaining the interpretability essential for clinical deployment.
• Abstract（参考訳）: 電子健康記録(EHR)には、予測モデリングを強化することができる豊富な非構造的な臨床ノートが含まれているが、これらのノートから有意義な特徴を抽出することは依然として困難である。 現在のアプローチは、作業集約型手技的特徴生成(CFG)から、解釈可能性や臨床関連性に欠ける完全自動表現的特徴生成(RFG)まで様々である。 SNOW(Scalable Note-to-Outcome Workflow)は,大規模言語モデル(LLM)を利用したモジュール型マルチエージェントシステムである。 SNOWは,Stanford Healthcareの147例において,手動CFG,クリニカルガイド下LPM法,RFG法を用いて5年間の前立腺癌再発の予測を行った。 手動CFGは最高性能 (AUC-ROC: 0.771) を達成したが、SNOWはこの性能 (0.761) に適合し、臨床的な専門知識は必要とせず、ベースライン性能 (0.691) とRFGのアプローチの双方を著しく上回った。 臨床用ガイド付きLSM法も良好に動作したが (0.732) 、まだ専門家の入力が必要であった。 SNOWの特殊エージェントは、機能発見、抽出、検証、後処理、集約を処理し、手動でのみアクセス可能な複雑な臨床情報をキャプチャする解釈可能な機能を作成する。 我々の研究は、自律型LLMシステムが専門家レベルの機能工学を大規模に再現できることを示し、臨床MLモデルが臨床展開に不可欠な解釈可能性を維持しながら、非構造化のEHRデータをどのように活用するかを変革する可能性があることを示唆した。

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